在基本农田里种黄柏树是违法的，除非经过特殊审批进行农业结构调整。以下是对此问题的详细分析：
法律依据与违法性分析
我国《中华人民共和国土地管理法》及《基本农田保护条例》均明确规定了基本农田的保护制度，强调保持基本农田的耕作性质和用途不得擅自改变。具体来说，《土地管理法》第三十七条明确规定：“禁止占用永久基本农田发展林果业”，这一规定直接指出了在基本农田上种树（包括黄柏树）的行为是违法的。
违法原因主要包括以下两点：
破坏耕地耕作层：树木的生长需要较深的根系，这会严重破坏基本农田的耕作层，导致土壤结构恶化，影响土壤的保水保肥能力，进而使原本适合农作物种植的优质耕地逐渐失去耕种条件。这种破坏是不可逆的，一旦发生，将难以恢复耕地的原有功能。
改变土地用途：基本农田的主要用途是进行粮食等农作物的种植，以保障国家的粮食安全。种黄柏树显然属于发展林果业，这明显改变了基本农田的农业用途，违反了土地利用的相关规定，也违背了国家设立基本农田保护制度的初衷。
特殊情况与合法调整
尽管在一般情况下，基本农田上种黄柏树是违法的，但也存在一些特殊情况。例如，在一些农田防护林建设项目中，为了改善农业生态环境、提高农业综合生产能力等目的，并且经过了相关部门的严格审批，在符合一定规划和条件的基础上，可以在基本农田周边或内部特定区域种植防护林带。这种植树造林行为属于合理的农业结构调整，是被法律允许的。但这种情况非常特殊，且需要严格的审批程序。
法律后果与建议
如果在基本农田上擅自种黄柏树，相关部门有权要求恢复原状、退还基本农田，并可能面临罚款等处罚。因此，我建议广大农民和土地使用者严格遵守相关法律法规，不要擅自在基本农田上种黄柏树或其他树木。如有需要进行农业结构调整或植树造林的项目，应事先咨询相关部门并办理审批手续，确保行为的合法性。
综上所述，为了保护我国的耕地资源和粮食安全，我们应共同遵守相关法律法规，维护基本农田的耕作性质和用途不受侵犯。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。