非法占用土地罪确实存在追诉时效，具体根据行政违法行为或刑事犯罪行为的性质，分别适用不同的追诉规则。以下是对此问题的详细解析：
一、行政处罚追诉时效
一般规定：
- 根据《行政处罚法》第三十六条，违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚；涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，上述期限延长至五年。法律另有规定的除外。
- 该期限从违法行为发生之日起计算；若违法行为有连续或者继续状态，则从行为终了之日起计算。
非法占用土地的适用：
- 非法占用土地通常被视为具有继续状态的违法行为。因此，其行政处罚的追诉时效从非法占用行为终了之日起开始计算两年。例如，若某人未经批准占用土地建房，且房屋一直未拆除，则非法占用土地的状态持续存在，直至房屋被拆除、土地恢复原状时，才视为行为终了，此时开始计算两年的追诉时效。
二、刑事追诉时效
适用情形：
- 当非法占用土地的行为情节严重，触犯《刑法》第三百四十二条规定的非法占用农用地罪时，需按照刑事追诉时效处理。该条规定，违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成耕地、林地等农用地大量毁坏的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。
具体追诉期限：
- 根据《刑法》第八十七条，非法占用农用地罪的法定最高刑为五年以下有期徒刑，因此其刑事追诉时效为五年，从犯罪行为终了之日起计算。
特殊情况：
- 在人民检察院、公安机关、国家安全机关立案侦查或者在人民法院受理案件以后，逃避侦查或者审判的，以及被害人在追诉期限内提出控告而相关机关应当立案而不予立案的，均不受追诉期限的限制。
三、实际应用与建议
- 对于行政处罚：如果非法占用土地的行为处于持续状态，且未被发现超过二年（或五年，如涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的），则可能不再受行政处罚。但一旦行为结束，如违法建筑被拆除，即开始计算追诉时效。
- 对于刑事处罚：对于构成非法占用农用地罪的，若行为发生后五年内未被追诉，则一般不再追究刑事责任。但若存在逃避侦查等行为，或案件已立案但未处理，则不受此时效限制。
- 建议：非法占用土地的行为可能面临严重的法律后果，包括行政处罚和刑事处罚。因此，建议个人和企业严格遵守土地管理法规，避免非法占用土地行为的发生。如果面临此类问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供准确的法律意见和应对策略。
综上所述，非法占用土地罪的追诉时效问题复杂多变，需根据具体情况判断。希望以上解答能对您有所帮助。