三方协议涂改后并不一定就作废，其效力需根据涂改情况、是否经各方同意及确认等因素综合判断。以下是对不同情况下涂改效力影响的详细分析：
涂改不影响效力的情况
三方协商一致涂改：
- 当三方均同意对协议内容进行修改，并在涂改处共同签字或盖章确认时，该涂改是有效的。这表示三方都知晓并接受了修改内容，协议依然具有法律效力。例如，若三方一致同意变更工作岗位，并在涂改处签字盖章，则修改后的协议内容对各方均具有约束力。
非关键条款涂改且不影响理解和履行：
- 对于协议中的非关键条款，如联系方式等细微信息的涂改，只要不影响协议的整体理解和正常履行，且未造成各方误解或沟通障碍，一般不会影响协议的效力。这种情况下，即使存在涂改，也不构成对协议主要权利义务关系的实质性改变。
使用修正工具并确认：
- 在涂改过程中使用改正液或修正带等工具，并由三方在修改处签字或盖章确认，同时确保相关确认流程完整（如学校就业办也进行了盖章确认），这样的涂改同样被视为有效。这确保了涂改的明确性和各方的知情权。
涂改可能产生不利影响的情况
单方擅自涂改：
- 任何一方未经其他两方同意擅自对协议进行涂改，该涂改部分将被视为无效。因为三方协议是基于三方的合意而成立的，单方面变更协议内容违反了这一原则。例如，毕业生擅自提高试用期工资，这种涂改对用人单位和学校不具有法律效力，还可能引发信任危机和法律纠纷。
关键条款涂改且未确认：
- 若涂改的是协议中的关键条款，如工作地点、工作岗位、薪资待遇等，且没有经过三方的签字或盖章确认，这将可能导致协议效力的不确定性。这些关键条款直接关系到各方的核心利益，未经确认的涂改可能引发争议，甚至导致协议无效或产生法律纠纷。
法律建议
- 签订前仔细核对：在签订三方协议前，务必仔细核对各项内容，确保无误后再签字或盖章。这是预防涂改风险的最有效方法。
- 变更时严格遵守流程：如确实需要变更协议内容，应严格遵守协商一致和正规流程的原则进行。在涂改处注明涂改的原因、日期，并由三方签字或盖章确认。
- 特殊情况处理：若学校或用人单位对三方协议的格式和内容有严格要求，甚至规定不允许涂改，应严格按照要求执行，不得擅自涂改。如需变更，应按照相关规定重新签订一份新的三方协议。
为了避免后续的法律风险和纠纷，建议各方在签订和变更三方协议时务必谨慎仔细。如果因涂改问题产生争议，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。