结论：公司被起诉后，在财产资产清算阶段，与法院相关的款项（如诉讼费、执行费等）一般不可以直接协商减少，但针对债务清偿的具体方案，包括还款期限、方式等，是可以与债权人进行协商的，并需法院认可。以下是对此问题的详细分析：

1. 与法院相关的费用：

   • 在公司被起诉并进入财产资产清算阶段，会涉及一些与法院相关的费用，如诉讼费、执行费等。这些费用是根据法律规定和案件具体情况来确定的，一般不可以直接与法院协商减少。
   • 诉讼费是原告在提起诉讼时需要预交的，根据案件的性质和标的额大小来确定。执行费则是在执行阶段产生的，由被执行人承担。这些费用的计算和收取都有明确的法律规定，法院会依法进行。

2. 与债权人的协商：

   • 虽然与法院相关的费用不能直接协商，但针对债务清偿的具体方案，公司（作为债务人）是可以与债权人进行协商的。
   • 协商的内容可以包括还款期限、还款方式、是否减免部分债务等。这些协商结果需要得到债权人的同意，并且最终需要得到法院的认可，才能作为清算方案的一部分执行。
   • 在协商过程中，公司可以积极展示自身的还款意愿和还款能力，以及当前的财务状况和经营情况，以争取债权人的理解和支持。

3. 清算方案的制定与执行：

   • 清算方案是由清算组（或管理人）制定的，用于明确债务清偿的顺序、方式、期限等。清算方案需要提交给法院进行审查，并最终由法院裁定认可后才能执行。
   • 在制定清算方案时，清算组会充分考虑公司的实际情况和债权人的利益，力求制定出一个公平、合理、可行的方案。如果公司与债权人能够达成协商一致，那么这些协商结果可以纳入清算方案中。

4. 法律后果与风险提示：

   • 如果公司未能按照清算方案或协商结果履行还款义务，债权人可以向法院申请强制执行，法院有权采取查封、扣押、拍卖等措施来强制执行公司的财产。
   • 因此，公司在与债权人协商时，应充分考虑自身的还款能力和实际情况，避免做出无法履行的承诺。同时，也应积极配合清算组的工作，确保清算方案的顺利制定和执行。

建议：针对公司被起诉后财产资产清算阶段与法院和债权人的协商问题，我建议公司积极与债权人进行沟通协商，争取达成一个双方都能接受的债务清偿方案。同时，也应密切关注清算组的动态和法院的裁定结果，确保公司的合法权益得到保障。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。