结论：法人章作为公司的重要印章，具有法律效力，且从法律合规性、公司内部管理及商业合作等多个角度考虑，建议公司应只刻制并使用一个经过备案的法人章，避免使用两个不一样的法人章。

详细分析：

1. 法律合规性角度：

   • 根据《印章治安管理办法》第五条，任何单位和个人不得非法制作、使用印章，企业法人章的刻制需到公安机关批准的刻制单位进行，并取得印章准刻证。这表明法人章的刻制是经过严格备案和审批程序的，私自刻制多个法人章属于违法行为。
   • 虽然《中华人民共和国公司法》未直接规定公司只能有一个法人章，但公章的管理办法及合同法等相关法律原则均强调公章（包括法人章）的唯一性。多个法人章可能导致公司行为的混乱和不确定性，增加法律风险。

2. 公司内部管理角度：

   • 多个法人章的存在会破坏公司内部管理的统一性。不同业务场景下使用不同的法人章，容易导致印章使用责任界定不清，增加未经授权使用印章的风险，从而给公司带来潜在的法律纠纷和经济损失。
   • 如果公司确实存在多枚法人章（如因业务需要或特殊情况），则必须建立严格规范的印章管理制度，明确每一枚法人章的使用范围、审批流程、保管责任人等内容，以确保印章使用的合法性、合规性和有序性。

3. 商业合作角度：

   • 多枚法人章可能会给合作方带来疑虑和不便。在涉及重要法律文件签署、重大交易等情况下，对方通常会要求确认所使用法人章的真实性和有效性。如果公司存在多个不一样的法人章，可能会引发合作方的信任危机，影响合作的顺利进行。
   • 公司需要额外做好沟通和解释工作，以消除合作方的顾虑，这无疑增加了合作的复杂性和成本。

特殊情况考虑：

• 在某些特殊情况下，如异地使用印章等，企业可按规定程序向有关部门申请办理相关手续，刻制备用章。但备用章同样需要进行备案，并在管理和使用上遵循严格要求，以确保其合法性和有效性。

建议：

• 为维护公司的法律权益和内部管理秩序，公司应严格遵守相关法律法规，只刻制并使用一个经过备案的法人章。
• 如果法人章遗失或需要更换，应及时向相关机关报备并重新刻制，确保法人章的唯一性和安全性。
• 如果公司确实存在多枚法人章的需求，应建立严格规范的印章管理制度，并确保每枚印章的合法性和有效性，以降低法律风险和管理成本。

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