结论：在协议书上仅写一个孩子并一直按一个孩子要抚养费的行为，其合法性需根据具体情况判断。若双方自愿且协议内容不违反法律规定，同时未损害未成年子女的合法权益，则该行为可能被视为合法；但若协议内容损害了未成年子女的合法权益，则该行为不合法。
分析：
协议自愿性：
- 如果双方（即父母双方）在离婚或分居时，自愿达成协议，仅就其中一个孩子的抚养费进行约定，并且这一约定是双方真实意思的表示，没有受到任何胁迫或欺诈，那么从协议自愿性的角度来看，这一行为可能是合法的。
协议内容合法性：
- 协议内容必须遵守法律法规的规定，不得损害国家、集体或第三人的利益，特别是不得损害未成年子女的合法权益。
- 如果协议中仅约定一个孩子的抚养费，而实际上两个孩子都需要抚养，且另一方没有能力或不愿意承担另一个孩子的抚养费，那么这种协议内容可能因损害未成年子女的合法权益而被视为不合法。
未成年子女权益保护：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，父母对未成年子女负有抚养、教育和保护的义务。
- 如果协议内容导致其中一个或两个未成年子女的合法权益受到损害，如生活、教育、医疗等基本需求无法得到满足，那么这种协议内容是不合法的，法院有权根据实际情况进行裁决，要求父母双方共同承担抚养责任。
实际履行情况：
- 即使协议内容在形式上合法，但如果在实际履行过程中，一方未按照协议约定支付抚养费，或者支付的费用不足以满足未成年子女的实际需求，那么另一方有权向法院提起诉讼，要求变更抚养费支付标准或要求对方承担更多的抚养责任。
建议：
- 在签订抚养协议时，双方应充分考虑未成年子女的实际需求和合法权益，确保协议内容既合法又合理。
- 如果双方对抚养费的支付存在争议或不确定如何约定，建议咨询专业律师或相关机构，以获取更具体的法律建议和指导。
- 在实际履行过程中，双方应严格按照协议约定支付抚养费，并保留好相关证据，以备不时之需。
可能后果：
- 如果协议内容合法且双方自愿履行，那么通常不会产生法律纠纷。
- 如果协议内容损害了未成年子女的合法权益或一方未按照协议约定支付抚养费，那么另一方有权向法院提起诉讼，要求变更抚养费支付标准或要求对方承担更多的抚养责任。法院将根据实际情况进行裁决，并可能要求违约方承担相应的法律责任。