被起诉的自然人完全可以做新公司的股东，但需根据具体情况考虑潜在的法律风险和限制。以下从不同角度为你详细分析：
一、法律层面：被起诉不影响股东资格
从法律条文的角度来看，被起诉本身并不构成成为公司股东的障碍。股东资格的取得主要基于出资或认购股份的行为，以及公司章程和股东名册的记载。只要自然人满足成为股东的基本条件，如具有完全民事行为能力、出资或认购股份等，就可以成为新公司的股东。
二、潜在风险与限制
尽管被起诉不影响股东资格，但被起诉的自然人在成为新公司股东时，仍需考虑潜在的法律风险和限制：
债务承担风险：
- 如果被起诉的自然人涉及的是民事纠纷，且最终判决其承担债务责任，那么其在新公司中的股权可能会成为执行对象。根据《最高人民法院关于民事执行中变更、追加当事人若干问题的规定》，如果被执行人（即被起诉的自然人）无财产可供执行，但持有其他公司的股权，法院可以裁定冻结、拍卖该股权以偿还债务。
信誉影响：
- 被起诉的自然人可能因诉讼而面临信誉受损的风险。这种信誉损害可能影响其在新公司中的融资能力、合作伙伴的选择以及市场声誉等。
公司治理限制：
- 在某些情况下，如果被起诉的自然人涉及的是与公司治理相关的诉讼（如违反竞业禁止、侵犯商业秘密等），其在新公司中的任职和决策权可能会受到限制。这取决于具体诉讼的性质和结果，以及新公司章程和内部管理制度的规定。
三、建议与措施
评估诉讼风险：
- 在成为新公司股东之前，被起诉的自然人应全面评估诉讼的风险和可能的结果。如果诉讼涉及重大债务或法律责任，建议谨慎考虑是否成为新公司股东，以避免给新公司带来不必要的法律风险。
咨询专业律师：
- 在涉及复杂法律问题时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议。律师可以根据具体情况分析诉讼风险、制定应对策略，并帮助被起诉的自然人了解成为新公司股东的法律后果和限制。
完善公司治理结构：
- 如果被起诉的自然人决定成为新公司股东，建议新公司完善治理结构，明确股东权利和义务，制定合理的决策机制和风险防控措施。这有助于降低因股东个人问题而给公司带来的法律风险。
考虑股权结构安排：
- 在股权结构安排上，可以考虑将部分股权委托给信任的第三方代持，或者通过设立家族信托等方式来隔离个人风险与新公司风险。当然，这些安排需要符合相关法律法规的规定，并咨询专业律师的意见。
总结来说，被起诉的自然人可以做新公司股东，但需根据具体情况考虑潜在的法律风险和限制。如果你有更具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。