结论：事故发生后，即使当时仅使用了交强险理赔，未超过两年仍可申请商业险理赔，但需满足保险合同约定的理赔条件，且需注意诉讼时效和保险条款的具体限制。

1. 交强险与商业险的理赔关系

交强险（机动车交通事故责任强制保险）和商业险（如第三者责任险、车损险等）是独立的保险合同，理赔互不影响。事故发生后，若交强险已赔付部分损失，剩余符合商业险赔付范围的损失（如超出交强险限额的部分、车损等），仍可向商业险保险公司申请理赔，时间限制取决于保险合同约定和诉讼时效，而非交强险是否已理赔。

2. 理赔的关键条件

• 保险合同有效性：商业险需在事故发生时处于有效期内，且未因未缴费、骗保等原因被解除合同。
• 事故属于保险责任：需符合商业险条款约定的赔付范围（如碰撞、自然灾害等），且无免责事由（如酒驾、无证驾驶等）。
• 及时报案与提供材料：需按合同约定时间（通常为48小时内）向保险公司报案，并提交事故证明、损失清单等材料。

3. 时间限制的注意事项

• 保险合同约定的索赔时效：部分商业险合同可能约定“自事故发生之日起2年内未提出索赔视为放弃权利”，但此类条款需以保险公司明确告知为前提，否则可能因未尽提示义务而无效。
• 诉讼时效：根据《民法典》，向保险公司请求赔偿的诉讼时效为3年，自知道或应当知道权利受损之日起计算。若保险公司拒绝理赔，需在3年内起诉，否则可能丧失胜诉权。

4. 实务建议

• 立即联系保险公司：即使已过2年，仍可尝试申请理赔，重点核查合同是否约定索赔时效及保险公司是否尽到提示义务。
• 收集证据：保留事故认定书、维修发票、医疗记录等材料，证明损失与事故的关联性。
• 协商或诉讼：若保险公司拒赔，可先协商；协商不成，可在诉讼时效内起诉，要求按合同赔付。

总结：未超过两年通常可申请商业险理赔，但需结合合同条款和时效规定综合判断。如有具体合同或拒赔情况，可进一步向我提供细节，我会为您分析理赔可行性。