结论：填写了赡养老人专项附加扣除后仍被扣税，可能是因为您的综合所得收入在扣除各项费用后仍超过了免征额，或者存在其他应税所得未纳入考虑，亦或是扣除项目填写有误或未完全生效。以下是对这一问题的详细分析：
一、综合所得收入超过免征额
免征额概念：根据个人所得税法，居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。如果您的综合所得收入在扣除这些费用后仍然超过了免征额（即六万元加上各项扣除后的余额仍为正数），那么您就需要缴纳个人所得税。
赡养老人扣除：赡养老人专项附加扣除是个人所得税法规定的一项扣除项目，旨在减轻纳税人赡养老人的经济负担。然而，这项扣除并不意味着您可以完全免缴个人所得税，而是减少了您的应纳税所得额。如果您的综合所得收入仍然较高，即使扣除了赡养老人的费用，也可能需要缴纳税款。
二、存在其他应税所得
应税所得范围：除了综合所得（工资、薪金所得，劳务报酬所得，稿酬所得，特许权使用费所得）外，个人所得税的应税所得还包括经营所得、利息、股息、红利所得、财产租赁所得、财产转让所得和偶然所得等。
其他所得影响：如果您除了综合所得外，还有其他应税所得，并且这些所得在扣除相关费用后仍然需要缴纳税款，那么即使您已经填写了赡养老人专项附加扣除，也可能因为其他所得的存在而需要缴纳个人所得税。
三、扣除项目填写有误或未完全生效
填写错误：在填写个人所得税申报表时，如果赡养老人专项附加扣除的填写有误（如填写了错误的扣除金额、未正确选择扣除方式等），可能导致扣除项目未完全生效或扣除金额不准确，从而影响您的应纳税额。
未完全生效：有时候，由于系统更新、数据同步等原因，您填写的扣除项目可能未能及时生效。在这种情况下，您可以联系当地税务机关或通过个人所得税APP等渠道查询扣除项目的生效情况，并进行相应的调整。
四、建议与措施
核对申报信息：首先，建议您仔细核对个人所得税申报表中的各项信息，确保赡养老人专项附加扣除的填写准确无误。
了解应税所得：其次，了解您的所有应税所得情况，包括综合所得和其他应税所得，以便更准确地计算应纳税额。
咨询税务机关：如果您对个人所得税的计算或扣除项目有疑问，可以联系当地税务机关或通过个人所得税APP等渠道进行咨询和查询。
及时调整申报：如果发现扣除项目填写有误或未完全生效，应及时进行调整并重新申报，以确保您的个人所得税计算准确无误。
如果您在个人所得税申报过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。