结论：房屋征收补偿后违法建筑被认定为合法建筑，是否可以重新要求补偿，需根据具体情况判断，主要包括征收补偿协议的效力、违法建筑认定的时间点以及是否存在欺诈或重大误解等因素。以下从不同角度进行详细分析：
一、征收补偿协议的效力
协议已履行完毕：
- 如果房屋征收补偿协议已经签订且履行完毕，即补偿款已支付，房屋已拆除或移交，那么通常情况下，该协议具有法律效力，双方应遵守。
- 在此情况下，即使违法建筑后续被认定为合法建筑，由于补偿协议已经基于当时的法律事实和双方协商达成，一般难以重新要求补偿。
协议未履行或部分履行：
- 如果征收补偿协议尚未履行或部分履行，且违法建筑在协议签订后被认定为合法建筑，那么情况可能有所不同。
- 此时，可以基于新的事实（违法建筑被认定为合法）与征收方重新协商补偿事宜，或者通过法律途径寻求救济。
二、违法建筑认定的时间点
征收前认定：
- 如果违法建筑在征收前已经被相关部门认定为违法，并进行了相应的处理（如罚款、限期拆除等），那么在征收时，该建筑通常不会被纳入补偿范围。
- 即使后续该建筑被认定为合法，由于征收时已经按照违法建筑处理，重新要求补偿的难度较大。
征收后认定：
- 如果违法建筑在征收后被认定为合法，且征收补偿协议尚未履行或部分履行，那么可以基于新的事实与征收方协商调整补偿方案。
- 如果征收补偿协议已经履行完毕，但违法建筑被认定为合法的事实对补偿结果有重大影响，且存在欺诈、重大误解等情形，那么可以通过法律途径寻求撤销或变更原补偿协议。
三、欺诈或重大误解的情形
欺诈：
- 如果征收方在签订补偿协议时故意隐瞒违法建筑的真实情况，或者提供虚假信息导致被征收方误签协议，那么被征收方有权基于欺诈主张撤销或变更协议。
重大误解：
- 如果被征收方在签订补偿协议时对违法建筑的性质存在重大误解，且该误解对补偿结果有重大影响，那么被征收方也有权基于重大误解主张撤销或变更协议。
四、法律建议
收集证据：
- 如果认为存在重新要求补偿的情形，应首先收集相关证据，包括违法建筑被认定的时间、征收补偿协议的签订和履行情况、是否存在欺诈或重大误解等。
协商与诉讼：
- 在收集证据的基础上，可以尝试与征收方进行协商，寻求调整补偿方案。
- 如果协商无果，可以考虑通过法律途径提起诉讼或申请仲裁，以维护自己的合法权益。
进一步思考：在处理此类问题时，还需要考虑当地的具体法律法规和政策规定，以及征收项目的具体情况和补偿标准等因素。因此，建议在实际操作中咨询专业律师，以获取更具体、更准确的法律建议。如果你有相关法律问题，可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况提供详细的法律解答。