结论：仅盖法人章的现金支票存根通常不具备单独使现金支票生效的法律效力，现金支票的有效性需结合支票本身要素及银行审核规则综合判断。以下从法律规范、实务操作、风险防范三个角度展开分析：

一、法律规范层面：支票生效需满足法定形式要件

根据《中华人民共和国票据法》第八十四条，现金支票作为“见票即付”的票据，其生效需同时满足以下核心要件：

1. 书面形式：必须使用统一印制的支票用纸，手写或打印内容需清晰可辨；
2. 绝对记载事项：包括表明“支票”字样、无条件支付的委托、确定的金额、付款人名称、出票日期、出票人签章（需同时加盖财务专用章和法人章）；
3. 相对记载事项：如付款地、出票地等，未记载不影响支票效力。

关键点：存根作为支票的附属联，其盖章行为本身不构成支票生效的独立要件。若支票正联未完整加盖财务专用章+法人章，或存在金额涂改、日期空白等瑕疵，即使存根盖章也无法补正支票效力。

二、实务操作层面：银行审核规则决定资金划转

银行在处理现金支票取现时，通常遵循以下流程：

1. 形式审查：核对支票正联的签章是否与预留印鉴一致（财务专用章+法人章）；
2. 实质审查：确认支票金额未超过账户余额、用途符合现金管理规定（如差旅费、备用金等）；
3. 存根处理：存根仅作为出票人记账凭证，银行一般不审核存根签章，但会要求出票人在存根联签字确认取现事实。

风险提示：若仅在存根加盖法人章而未在支票正联签章，银行有权以“签章不全”为由拒绝付款。即使银行未当场拒付，后续审计中也可能因支票形式瑕疵要求出票人承担责任。

三、风险防范建议：规范用章流程避免纠纷

1. 双章并用原则：现金支票出票时，必须同时加盖财务专用章和法人章，缺一不可；
2. 存根管理：存根联可加盖法人章作为内部控制手段，但需与支票正联的签章行为分离，避免混淆法律效力；
3. 印章保管：建议将财务专用章与法人章分人保管，使用时履行审批登记程序，防止私自用章风险；
4. 电子支票替代：考虑使用银行企业网银的电子支票功能，通过数字签名替代实物盖章，降低操作风险。

延伸提醒：若公司存在频繁现金支取需求，建议完善《现金管理制度》，明确支票使用审批流程，并定期与银行对账，避免因支票管理不善引发资金安全或税务合规问题。如有具体操作疑问，可进一步提供细节，我将结合《支付结算办法》等法规为您分析。