关于挪用寺院公款罪的立案标准，这实际上与挪用公款罪的普遍立案标准是一致的，因为寺院公款也属于公共财产的范畴。以下是根据相关法律规定及司法解释，对挪用公款罪立案标准的详细解析：
一、挪用公款进行非法活动
立案标准：
- 若行为人挪用寺院公款用于非法活动，如赌博、走私等违反国家法律、法规的行为，且数额在三万元以上（尽管有观点认为5千元以上即可，但依据更严格的法律规定，通常采用三万元以上的标准），即应依照刑法相关规定以挪用公款罪追究刑事责任。
- 特别指出，若挪用公款进行非法活动，无论数额多少，只要达到一定严重程度（如涉及重大社会影响或严重危害公共安全等），也可能构成犯罪并应予立案。但在此我们主要依据数额标准进行说明。
情节严重：
- 若挪用公款数额在一百万元以上，或挪用特定款物（如救灾、抢险、防汛等，在寺院公款中若涉及此类特定用途的资金也同理）数额在五十万元以上不满一百万元，或挪用公款不退还且数额在五十万元以上不满一百万元，以及其他严重情节，均属于“情节严重”的情形。
二、挪用公款进行营利活动或超过三个月未还
数额较大：
- 若行为人挪用寺院公款用于营利活动，如经商、投资、购买股票等能获取经济利益的活动，且数额在五万元以上，即应认定为“数额较大”，应予立案追诉。
数额巨大：
- 若挪用公款数额在五百万元以上，则应当认定为“数额巨大”。
情节严重：
- 具有以下情形之一的，同样应认定为“情节严重”：
- 挪用公款数额在二百万元以上；
- 挪用特定款物数额在一百万元以上不满二百万元；
- 挪用公款不退还且数额在一百万元以上不满二百万元；
- 其他严重情节，如挪用公款导致寺院运营严重困难、造成重大社会影响等。
其他个人用途：
- 若行为人挪用寺院公款既不是为了非法活动，也不是为了营利活动，而是出于其他个人用途（如生活消费等），并且数额较大（五万元以上）且在挪用后三个月内未归还的，也应当立案追诉。
三、其他重要考虑因素
累计计算：
- 对于多次挪用寺院公款不还的，应将挪用公款数额累计计算，以确定是否达到立案标准。
共犯处理：
- 若使用人与挪用人共谋、指使或参与策划取得挪用款，将以挪用公款罪的共犯定罪处罚。
从重处罚情形：
- 挪用寺院公款用于救灾、抢险、防汛等特定用途（若寺院有此类资金）归个人使用的，应从重处罚。
地区差异与具体执行：
- 各省级人民检察院可根据本地实际情况，在上述数额幅度内确定具体执行标准，并报最高人民检察院备案。因此，在实际操作中，还需参考当地的具体规定。
四、综合建议
挪用寺院公款罪的立案标准严格而明确，旨在打击滥用职权、侵害公共财产权益的犯罪行为。对于涉嫌挪用寺院公款的人员，建议及时咨询专业律师，了解自身法律责任和风险，以便采取合适的应对措施。同时，寺院也应加强财务管理和监督机制，预防挪用公款行为的发生，确保寺院的正常运营和公共财产的安全。