核心结论：发现被代偿还款后又把钱还回原机构，一般情况下若还款操作无误且机构确认收款，通常不会产生严重法律后果，但需关注是否存在重复还款、代偿方与原机构沟通不畅等潜在风险，可通过保留凭证、与机构确认等方式妥善处理。以下是具体分析：

1. 若还款操作无误且机构确认收款，通常无需过度担忧

• 法律性质：代偿是指第三方（如担保公司、保险公司）为债务人履行还款义务后，取得对债务人的追偿权。若您发现被代偿后，主动将款项还至原机构（如银行、贷款方），且还款金额、账户信息准确无误，原机构也确认收到款项，则您的还款行为有效，债务关系可能因此终结或部分清偿。
• 操作建议：保留还款凭证（如转账记录、回单、机构出具的收款确认书），以备后续核对。若代偿方曾向您追偿，可主动联系代偿方说明情况，避免因信息不对称导致重复追偿。

2. 需警惕的潜在风险及应对措施

• 风险一：重复还款
  若您既向原机构还款，又未与代偿方沟通清楚，可能导致代偿方仍认为您未履行还款义务，继续追偿。此时需提供原机构的收款凭证，证明债务已清偿。
• 风险二：代偿方与原机构沟通不畅
  部分情况下，代偿方与原机构可能存在信息延迟或系统对接问题，导致代偿方未及时更新您的还款状态。此时需主动联系代偿方，提供原机构收款凭证，要求其停止追偿并更新记录。
• 风险三：利息或费用计算争议
  若代偿涉及利息、违约金等费用，需确认还款金额是否覆盖全部费用。若原机构或代偿方主张额外费用，可要求其提供明细，并核对合同约定，避免不合理收费。

3. 若已产生纠纷，如何维权？

• 协商解决：优先与原机构、代偿方沟通，说明情况并提供凭证，要求其出具书面结清证明。
• 投诉或举报：若机构拒绝配合，可向当地银保监会、金融监管局或消费者协会投诉，反映机构未及时更新还款状态或违规收费问题。
• 法律途径：若纠纷无法通过协商或投诉解决，可向法院起诉，要求确认债务已清偿并赔偿损失（如因机构过错导致的信用受损、额外费用等）。

总结：您的行为本身不违法，但需通过保留凭证、主动沟通等方式规避潜在风险。若已产生纠纷，可根据具体情况选择协商、投诉或诉讼途径解决。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。