在刑事案件中，当事人的实控公司有多个，并不意味着所有公司都会被查，是否会被查取决于多种因素。以下从不同角度进行分析：

1. 案件性质与侦查需求：

   • 侦查机关在办理刑事案件时，会根据案件的性质、犯罪嫌疑人的行为以及侦查需求来决定调查范围。如果案件涉及的经济活动或资金流动与某个或某些实控公司密切相关，那么这些公司很可能会成为侦查的重点。
   • 例如，如果犯罪嫌疑人被指控涉嫌诈骗犯罪，且诈骗资金通过其实控的某个公司进行流转，那么该公司就很可能被侦查机关调查。

2. 公司实际运营情况：

   • 并非所有实控公司都会直接参与犯罪活动。如果某些公司只是名义上的实控，而实际运营与犯罪嫌疑人无关，或者这些公司并未涉及任何违法犯罪行为，那么它们被查的可能性就相对较小。
   • 侦查机关在调查时，会注重证据的收集和事实的查明，不会随意扩大调查范围。

3. 侦查策略与资源分配：

   • 侦查机关在办理案件时，会根据案件的复杂程度、涉案金额、社会影响等因素来制定侦查策略，并合理分配侦查资源。如果案件涉及多个实控公司，但侦查资源有限，那么侦查机关可能会优先调查与案件直接相关的公司。
   • 此外，侦查机关也可能根据案件进展和证据收集情况，动态调整调查范围。

4. 法律程序与权利保障：

   • 在侦查过程中，侦查机关必须遵守法定程序，保障犯罪嫌疑人的合法权益。如果侦查机关认为需要调查某个实控公司，必须依法进行，并确保调查行为的合法性和正当性。
   • 犯罪嫌疑人及其辩护律师也有权对侦查机关的调查行为提出异议，并要求侦查机关依法进行调查。

建议：

• 如果您或您的亲友涉及刑事案件，且实控多个公司，建议及时咨询专业律师，了解案件的具体情况和侦查机关的调查范围。
• 律师可以根据案件情况，为您提供法律建议，帮助您了解自己的权利和义务，并协助您应对侦查机关的调查。
• 同时，您也应积极配合侦查机关的调查工作，如实提供相关信息和证据，以维护自己的合法权益。

后续行动：

• 如果您有任何关于刑事案件或实控公司被查的具体问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律解答和建议。