书店发现盗版书后，应当采取以下措施来处理：

1. 立即停止销售并隔离盗版书籍：

   • 一旦发现盗版书籍，书店应立即停止销售，并将这些书籍从销售区域隔离出来，以防止进一步扩散和造成更大的法律风险。

2. 收集证据：

   • 书店应收集所有与盗版书籍相关的证据，包括书籍本身、销售记录、进货单据等。这些证据在后续的法律程序中可能起到关键作用，有助于证明书店的侵权行为和损失情况。

3. 联系版权方或出版社：

   • 书店应尽快联系版权方或出版社，告知他们发现了盗版书籍的情况。版权方或出版社通常会提供进一步的指导，包括如何处理盗版书籍、是否需要报警或采取法律行动等。

4. 考虑报警或向相关行政部门举报：

   • 如果盗版书籍的数量较大或情节严重，书店可以考虑向当地公安机关报警，或者向文化市场综合执法机构等行政部门举报。这些机构有权对盗版行为进行调查和处理，并可能给予书店一定的法律支持和保护。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国著作权法》第四十八条的规定，未经著作权人许可，复制、发行、表演、放映、广播、汇编、通过信息网络向公众传播其作品的，属于侵权行为。书店销售盗版书籍即属于未经著作权人许可复制、发行其作品的行为，因此可能面临法律责任。同时，根据《中华人民共和国商标法》的相关规定，如果盗版书籍还涉及侵犯商标权，书店也可能需要承担相应的法律责任。

5. 配合调查并承担责任：

   • 如果书店被卷入法律纠纷或行政调查中，应积极配合相关部门的工作，提供必要的证据和信息。如果书店确实存在侵权行为，应主动承担责任，包括停止侵权、赔偿损失等。

6. 加强内部管理，防止类似事件再次发生：

   • 书店应加强内部管理，完善进货渠道和审核机制，确保所销售的书籍都是正版且合法授权的。同时，书店还可以加强对员工的培训和教育，提高他们的法律意识和版权保护意识。

可能面临的法律后果：

• 如果书店被证实销售盗版书籍，可能面临民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。民事赔偿可能包括赔偿版权方的经济损失和合理费用；行政处罚可能包括罚款、没收违法所得等；如果情节严重，书店的负责人或直接责任人员还可能面临刑事责任。

建议：

• 书店在日常经营中应严格遵守相关法律法规，尊重和保护知识产权。如果发现盗版书籍或其他侵权行为，应及时采取措施进行处理，并积极配合相关部门的工作。
• 如果书店对如何处理盗版书籍或相关法律问题存在疑问，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和建议。