关于非法转包建设工程合同下的入伙退伙协议是否有效的问题，结论需分情况讨论：
非法转包合同本身的效力问题
- 根据《中华人民共和国民法典》第七百九十一条及《建筑法》的相关规定，承包人不得将其承包的全部建设工程转包给第三人，或将其承包的全部建设工程支解以后以分包的名义分别转包给第三人。这种行为被明确禁止，因此非法转包的建设工程合同本身是无效的。
入伙退伙协议在非法转包背景下的效力
- 若入伙退伙协议内容独立于非法转包合同：即入伙退伙的约定不直接依赖于非法转包合同的效力，且不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么该入伙退伙协议可能有效。但这种情况较为罕见，因为在实际操作中，入伙退伙往往与非法转包紧密相关。
- 若入伙退伙协议直接依赖于非法转包合同：即入伙退伙的约定是基于非法转包合同而作出的，那么由于非法转包合同本身无效，根据合同效力的从属性原则，入伙退伙协议也将因非法转包合同的无效而无效。
法律后果与风险提示
- 无效合同的法律后果：根据《民法典》的相关规定，无效的合同自始没有法律约束力。因该合同取得的财产，应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失；双方都有过错的，应当各自承担相应的责任。
- 风险提示：在非法转包的建设工程中，参与各方均可能面临法律风险。对于转包方而言，可能面临行政处罚、民事赔偿等责任；对于入伙方而言，可能因合同无效而无法获得预期收益，甚至可能因参与非法活动而承担法律责任。
建议与行动指南
- 避免非法转包：各方应严格遵守法律法规，避免参与非法转包活动，以维护自身合法权益和市场秩序。
- 审查合同效力：在签订任何合同前，应仔细审查合同内容，确保合同不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
- 寻求法律帮助：若已涉及非法转包或相关纠纷，建议及时咨询专业律师，了解自身权利义务，制定合适的应对策略。
总结来说，非法转包建设工程合同下的入伙退伙协议的效力取决于其是否独立于非法转包合同以及是否违反法律法规的强制性规定。在实际操作中，由于非法转包合同本身无效，因此与之紧密相关的入伙退伙协议也很可能无效。各方应严格遵守法律法规，避免参与非法活动，并在必要时寻求法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。