厂里通过微信转账发放工资并不直接违法，但可能存在一些潜在风险和合规性问题，需要特别注意。以下从多个角度为你详细分析：
合法性基础
货币形式支付：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。这里的“货币形式”并未明确排除电子支付手段，因此微信转账作为电子支付的一种，在法律上并不被直接禁止。
约定自由权：发放工资的形式属于企业与员工之间的约定自由权。只要双方在劳动合同中有明确约定，且不违反法律法规的强制性规定，该约定即具有法律效力。
合规性要求与潜在风险
税务监管问题：
- 微信转账难以直接关联企业账户，可能导致个人所得税申报与实际收入不符，从而引发税务风险。
- 企业若未依法代扣代缴税款，将违反《税收征收管理法》，可能面临追缴税款及罚款的风险。
劳动关系认定争议：
- 非正规支付方式可能模糊雇佣关系边界，特别是在劳务外包或临时工场景中，可能影响工伤赔偿、社保缴纳等权益的归属。
资金安全风险：
- 个人微信账户无企业账户的资金托管功能，可能出现款项被挪用、延迟到账等问题。
- 电子支付平台的技术故障或网络攻击也可能造成工资发放中断。
举证困难隐患：
- 在劳动仲裁或诉讼中，微信转账记录可能面临取证困难的问题，其真实性易被质疑。相比之下，银行流水具有更强的法律效力。
建议措施
优先采用银行代发：
- 通过企业对公账户直接转账至员工银行卡，既符合监管要求，又能自动生成可查询的流水记录，便于管理和举证。
补充书面协议：
- 若确需使用微信转账，应与员工签订书面协议，明确支付方式、时间、金额及双方权利义务，以降低法律风险。
强化财务管理：
- 建立完整的工资支付台账，保存微信转账凭证、聊天记录等证据材料，并定期与员工核对账目，确保工资发放的准确性和可追溯性。
确保税务合规：
- 企业应按照税收法律法规的要求，依法代扣代缴个人所得税，避免利用微信转账等隐蔽方式逃避税收义务。
总结来说，虽然微信转账发放工资在法律上并不被直接禁止，但企业应充分考虑其潜在风险和合规性问题，并采取相应措施加以防范。如果你在工资福利方面还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。