核心结论：祖坟在他人承包地被挖毁，可通过协商、行政投诉、民事诉讼、刑事控告（若构成犯罪）等途径解决，具体如下：

1. 协商解决
   首先尝试与承包地使用人（如承包户、实际经营者）直接沟通，明确要求其停止侵害、恢复原状（如回填土地、修复墓碑）并赔偿损失。协商时需注意：

   • 保留沟通记录（如录音、书面协议）；
     
   • 明确赔偿范围（如重新安葬费用、精神损害抚慰金等）；
     
   • 若对方拒绝协商或态度恶劣，可转向其他途径。

2. 行政投诉
   若协商无果，可向当地自然资源部门（原国土局）或农业农村部门投诉，要求查处非法挖毁土地、破坏墓地的行为。依据：

   • 《土地管理法》第七十五条：禁止占用耕地建窑、建坟或挖砂、采石等破坏种植条件，违者由相关部门责令改正或治理，并可罚款；
     
   • 《殡葬管理条例》第二十条：禁止在承包地内擅自修建坟墓，但若已存在祖坟，承包人无权擅自挖毁，否则可能涉及行政处罚。
     行政投诉可推动政府介入调查，形成压力，但赔偿仍需通过民事途径解决。

3. 民事诉讼
   若损失较大或对方拒不赔偿，可向法院提起侵权责任纠纷诉讼，要求对方：

   • 停止侵害（如停止继续挖毁）；
     
   • 恢复原状（如修复墓地）；
     
   • 赔偿损失（包括物质损失如重新安葬费用、精神损害抚慰金等）。
     关键证据：土地权属证明（如村集体证明、祖坟历史存在证据）、挖毁现场照片/视频、损失清单、证人证言等。

4. 刑事控告（若构成犯罪）
   若挖毁行为情节严重（如故意毁坏财物价值较大、侮辱尸体等），可向公安机关报案，追究对方刑事责任：

   • 故意毁坏财物罪：若挖毁导致墓碑、棺木等财物损失达5000元以上（各地标准可能不同），可立案追诉；
     
   • 侮辱尸体罪：若挖毁行为伴随侮辱、亵渎尸体（如抛尸、裸露等），可立案追诉。
     刑事立案后，可同时提起刑事附带民事诉讼，要求赔偿损失。

行动建议：

1. 立即固定证据（拍照、录像、报警记录等）；
   
2. 联系村委会或当地政府协调处理；
   
3. 根据损失程度和对方态度，选择协商、行政投诉或诉讼；
   
4. 若涉及刑事犯罪，果断报案。
   

提示：祖坟涉及民族习俗和情感，处理时需兼顾法律与情理，避免矛盾激化。如有疑问，可直接向我咨询具体操作细节。