在医疗纠纷中，如果两家医院都被认定为承担次要责任，那么它们的赔偿方式、比例及具体项目需要依据相关法律法规以及案件的实际情况来综合确定。以下是对这一问题的详细解答：
一、赔偿范围与项目
当医院被认定为次要责任时，其赔偿项目通常涵盖患者因医疗纠纷所产生的多项合理损失，包括但不限于：
医疗费：根据患者实际支付的医疗费用凭证来计算，同时需要扣除医保已经报销的部分。这包括挂号费、检查费、治疗费、药费等所有与医疗相关的费用。如果结案后患者确需继续治疗，那么后续的基本医疗费用也应由责任方承担。
误工费：如果患者有固定收入，那么误工费将按照其实际减少的收入来计算。如果患者没有固定收入，那么可以按照医疗事故发生地上一年度职工年平均工资或者其最近三年的平均收入（如果能够举证的话）来计算。
护理费（或称陪护费）：护理费的计算依据是护理人员的收入状况、护理人数以及护理期限。如果护理人员有收入，那么参照误工费的规定来计算；如果护理人员没有收入或者雇佣的是护工，那么参照当地护工的劳务报酬标准来计算。
交通费：交通费是根据患者及其必要的陪护人员因就医或者转院治疗而实际发生的费用来计算的，需要凭正式的票据来报销。
住院伙食补助费：这项费用是参照当地国家机关一般工作人员的出差伙食补助标准来确定的。
营养费：营养费是根据受害人的伤残情况，并参照医疗机构的意见来确定的。
残疾赔偿金（或称残疾生活补助费）：如果医疗纠纷导致了患者的残疾，那么残疾赔偿金将根据伤残等级和丧失劳动能力程度来计算。计算标准通常是按照受诉法院所在地上一年度城镇居民人均可支配收入或者农村居民人均纯收入标准，自定残之日起按一定年限（如20年，但60周岁以上的每增加一岁减少一年，75周岁以上的按5年计算）来计算。
残疾用具费：如果患者因残疾需要配置补偿功能的器具，那么这项费用将凭医疗机构的证明，按照普及型器具的费用来计算。
丧葬费（如适用）：如果医疗事故导致了患者的死亡，那么丧葬费将按照医疗事故发生地规定的丧葬费补助标准来计算。
被扶养人生活费（如适用）：这项费用是以死者生前或者残疾者丧失劳动能力前实际扶养且没有劳动能力的人为限来计算的，按照户籍所在地或者居所地居民最低生活保障标准来支付。
住宿费（如适用）：如果患者及其必要的陪护人员因就医或者转院治疗而产生了住宿费用，那么这项费用将按照医疗事故发生地国家机关一般工作人员的出差住宿补助标准来计算，并凭据支付。
精神损害抚慰金：这项费用是根据侵权人的过错程度、侵害手段、场合、行为方式等具体情节以及侵权行为后果来确定的。可以按照医疗事故发生地居民年平均生活费来计算，具体年限根据造成患者死亡或者残疾的情况来确定（如死亡最长不超过6年，残疾最长不超过3年）。
二、划分责任比例
当医院被认定为承担次要责任时，其赔偿责任比例通常在10%至40%之间。这个比例并不是固定的，而是需要结合案件的实际情况，由法院或者相关的鉴定机构根据医疗过失行为在损害后果中的作用大小来判定。如果两家医院都被认定为次要责任，那么它们之间的责任比例可能会根据各自的过失程度来进一步划分。
三、赔偿方式与流程
收集证据：患者及其家属应全面收集与医疗纠纷相关的证据材料，包括医疗记录、费用凭证、证人证言等。
鉴定与评估：通过医疗事故技术鉴定或者相关的机构进行鉴定评估，明确医院责任程度和患者损失情况。这是确定赔偿比例和项目的重要依据。
协商赔偿：双方可以在自愿、平等的基础上就赔偿问题进行协商，达成一致后签订赔偿协议。这种方式比较灵活，可以节省时间和成本。
调解赔偿：如果协商不成，双方可以通过第三方调解机构（如医疗纠纷人民调解委员会）进行调解，促使双方达成赔偿协议。调解机构会提供中立的意见和建议，帮助双方找到合理的解决方案。
诉讼赔偿：如果协商或者调解都不成，患者或者其家属可以向法院提起民事诉讼，由法院依法判决。法院会根据相关法律法规和案件实际情况来判定赔偿比例和项目。
赔偿执行：根据协商结果、调解协议或者法院判决，医院需要按照规定的比例和项目对患者进行赔偿。如果医院不履行赔偿义务，患者或者其家属可以申请强制执行。
综上所述，当两家医院在医疗纠纷中被认定为承担次要责任时，它们的赔偿问题涉及多个方面，包括赔偿范围、项目、比例以及赔偿方式与流程等。患者及其家属应充分了解自身权益和赔偿流程，积极维护自己的合法权益。