关于互碰互赔超过2000元的赔偿问题，结论前置如下：
若双方均投保了交强险及商业三者险：在互碰互赔的情况下，超过2000元的部分，通常可以通过各自的商业三者险进行赔偿。具体赔偿比例和限额需根据保险合同的约定来确定。
若一方或双方未投保商业三者险，或保险赔偿不足：则超出部分需由事故责任方自行承担。若双方均有责任，则根据责任比例分担超出部分的赔偿。
详细解释与说明：
在交通事故中，互碰互赔是一种常见的处理方式，它指的是在双方都有责任的情况下，各自向自己的保险公司申请赔偿，而不是互相向对方索赔。当赔偿金额超过交强险的财产损失赔偿限额（通常为2000元）时，就需要考虑商业三者险的赔偿了。
一、商业三者险的作用：
商业三者险是交强险的补充，用于赔偿因交通事故造成的第三方人身伤亡和财产损失。当交强险的赔偿限额不足以覆盖全部损失时，商业三者险可以提供额外的赔偿保障。
二、赔偿流程与比例：
报案与定损：事故发生后，双方应及时向各自的保险公司报案，并等待保险公司进行定损。定损是确定损失金额的重要步骤，也是后续赔偿的依据。
提交赔偿申请：根据定损结果，双方各自向自己的保险公司提交赔偿申请，并提供相关证明材料，如事故认定书、定损单、维修发票等。
赔偿比例与限额：保险公司会根据保险合同的约定，确定赔偿比例和限额。在互碰互赔的情况下，如果双方均投保了商业三者险，且赔偿金额超过了交强险的限额，那么超出部分通常会按照各自的责任比例，通过商业三者险进行赔偿。
自行承担部分：如果一方或双方未投保商业三者险，或者商业三者险的赔偿限额不足以覆盖全部损失，那么超出部分将由事故责任方自行承担。
三、特殊情况处理：
无责方赔偿：在互碰互赔中，如果一方被认定为无责方，但其车辆也受到了损失，那么无责方可以向自己的保险公司申请赔偿（交强险中的无责财产损失赔偿限额通常为100元），或者向全责方的保险公司申请赔偿（在全责方投保了商业三者险的情况下）。
争议解决：如果双方在赔偿问题上存在争议，可以通过协商、调解或诉讼等方式解决。在诉讼过程中，法院将根据事故责任认定、保险合同约定以及相关法律法规，作出公正的判决。
四、建议与提醒：
及时投保：为了保障自己的合法权益，建议车主及时投保交强险和商业三者险，并确保保险金额充足。
保留证据：在事故发生后，务必保留好相关证据，如事故现场照片、事故认定书、定损单、维修发票等，以便在后续赔偿过程中提供证明。
咨询专业律师：如果在赔偿过程中遇到复杂问题或争议，建议及时咨询专业律师，以获取专业的法律意见和帮助。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。