针对出租车异地营运做笔录不承认的情况，处罚措施需根据具体违法事实和证据来综合判定，但一般可能涉及以下几种处理方式：

1. 若证据确凿，出租车确实存在异地营运行为：

   • 即便驾驶员在做笔录时不承认，交通管理部门仍可依据《中华人民共和国道路运输条例》等相关法律法规，对出租车驾驶员或所属公司进行处罚。处罚措施可能包括罚款、暂扣或吊销道路运输经营许可证、车辆营运证等。具体罚款数额会根据违法情节的严重程度、是否造成不良影响等因素来综合确定。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国道路运输条例》第六十三条，违反本条例的规定，未取得道路运输经营许可，擅自从事道路运输经营的，由县级以上道路运输管理机构责令停止经营；有违法所得的，没收违法所得，处违法所得2倍以上10倍以下的罚款；没有违法所得或者违法所得不足2万元的，处3万元以上10万元以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。对于出租车异地营运，虽可能不完全等同于“未取得道路运输经营许可擅自从事道路运输经营”，但该条例的精神在于打击非法营运行为，交通管理部门可参照此精神，结合具体地方性法规进行处罚。

2. 若证据不足，无法证明出租车存在异地营运行为：

   • 如果交通管理部门在调查过程中，无法收集到足够的证据来证明出租车确实存在异地营运行为，那么即便驾驶员在做笔录时不承认，也不能随意对其进行处罚。此时，交通管理部门应继续深入调查，收集更多证据，或者根据现有证据作出不予处罚的决定。
   • 法律原则：在行政处罚中，必须遵循“以事实为依据，以法律为准绳”的原则。没有确凿证据，不得随意对当事人进行处罚，这是保障当事人合法权益的重要体现。

3. 驾驶员不承认行为的法律后果与应对：

   • 驾驶员在做笔录时不承认异地营运行为，并不意味着可以逃避法律责任。如果交通管理部门最终收集到了足够的证据证明其违法事实，那么驾驶员仍需承担相应的法律责任。
   • 建议：对于驾驶员而言，如果确实存在异地营运行为，应如实陈述事实，配合交通管理部门的调查工作。试图通过不承认来逃避法律责任，往往只会加重处罚或带来更严重的法律后果。同时，驾驶员也有权对交通管理部门的处罚决定提出异议或申请行政复议、提起行政诉讼等，以维护自己的合法权益。

总结与建议：

• 出租车异地营运做笔录不承认时，处罚措施需根据具体违法事实和证据来综合判定。
• 驾驶员应如实陈述事实，配合调查工作，避免试图通过不承认来逃避法律责任。
• 如果对处罚决定有异议，可以依法提出异议或申请行政复议、提起行政诉讼等。

如有任何进一步疑问或需要具体法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。