针对乡镇发现违法占地后的制止措施，结合我国现行法律框架及实务操作，现从行政执法、民事救济、刑事追责三个维度为您详细说明：

一、行政执法层面的制止措施（核心手段）

1. 立即制止违法行为
   根据《土地管理法》第七十七条，乡镇人民政府发现违法占地行为后，应第一时间向违法行为人发出《责令停止违法行为通知书》，要求其立即停止施工、恢复原状。若对方拒不配合，可联合县级自然资源部门采取查封施工设备、封锁现场等强制措施。

2. 启动调查程序
   乡镇政府需在3个工作日内将案件移交县级自然资源主管部门，由其开展实地勘测、询问当事人、调取权属证明等调查工作。根据《行政处罚法》第三十六条，调查期限一般不超过30日，特殊情况可延长至60日。

3. 作出行政处罚决定
   经调查确认违法事实后，县级自然资源部门可依据《土地管理法》第七十七条作出：

• 责令退还非法占用的土地；
  
• 限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施（符合规划的可没收）；
  
• 并处非法占用土地每平方米100元以上1000元以下罚款。

1. 申请法院强制执行
   若当事人逾期不履行处罚决定，根据《行政强制法》第五十三条，行政机关可自期限届满之日起3个月内，向土地所在地有管辖权的人民法院申请强制执行。实务中需准备《强制执行申请书》、处罚决定书、催告书等材料。

二、民事救济途径（补充手段）

1. 相邻权纠纷诉讼
   若违法占地行为侵害相邻方通行、采光、排水等权益，受害人可依据《民法典》第二百八十八条提起相邻权纠纷诉讼，要求停止侵害、排除妨碍、赔偿损失。需注意诉讼时效为3年，自知道权益受损之日起计算。

2. 物权保护请求权
   土地权利人（如集体经济组织）可依据《民法典》第二百三十五条主张返还原物请求权，要求违法占有人返还土地。若土地已被破坏，可同时主张恢复原状请求权。

三、刑事追责情形（严重违法时）

1. 非法占用农用地罪
   根据《刑法》第三百四十二条，违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大（基本农田5亩以上/其他农用地10亩以上），造成耕地等农用地大量毁坏的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。

2. 行政执法与刑事司法衔接
   乡镇政府发现涉嫌犯罪的，应依据《行政执法机关移送涉嫌犯罪案件的规定》在24小时内向公安机关移送案件，并附调查报告、鉴定意见等材料。公安机关需在3日内作出是否立案的决定。

实务建议

1. 证据固定优先
   发现违法占地时，应第一时间通过拍照、录像、公证等方式固定现场状况，制作《现场勘验笔录》并由当事人签字确认。若当事人拒签，可邀请基层组织人员见证。

2. 多部门联动机制
   建议乡镇政府建立与自然资源、农业农村、公安等部门的联合执法机制，对重大违法案件开展联合执法。例如2021年某省开展的”大棚房”专项整治中，通过多部门协作成功拆除违法建筑1200余处。

3. 普法宣传预防
   定期开展《土地管理法》《城乡规划法》等法律法规宣传活动，重点向农村集体经济组织、村民委员会普及土地审批程序、违法后果等知识。可制作”违法占地风险告知书”发放给拟用地单位。

如您遇到具体案件需要进一步分析，可直接向我提供违法占地位置、面积、用途等关键信息，我将结合当地政策为您制定详细应对方案。