三方协议确实属于民事合同。以下是对这一结论的详细解释：

一、法律性质

三方协议，即《全国普通高等学校毕业生就业协议书》，是在毕业生、学校和用人单位三方之间签订的一种书面约定。其法律性质为民事协议，具体属于民法、合同法上的“预约”。因此，三方协议主要受《中华人民共和国民法典》的约束，而非《劳动合同法》等劳动法律法规。

二、与劳动合同的区别

1. 主体不同：三方协议的主体包括毕业生、学校和用人单位，而劳动合同的主体仅为劳动者和用人单位。
2. 内容不同：三方协议主要明确三方在毕业生就业工作中的权利和义务，约定毕业生和用人单位的就业意向，不涉及劳动合同中的劳动报酬、工作内容、劳动纪律等具体劳动内容。因此，三方协议不具有劳动合同的效力。

三、三方协议的法律效力

三方协议在平等、自愿的基础上签订，一旦签订即具有法律效力。如果一方违反协议约定，可能需要承担民事赔偿责任。例如，如果毕业生违约，依据《中华人民共和国民法典》的相关规定，违约方需要承担预约合同的违约责任。

四、实际应用中的注意事项

1. 签订前需谨慎：在签订三方协议前，毕业生应仔细了解协议内容，特别是违约责任条款，以确保自身权益。
2. 违约需谨慎：如果毕业生在签订三方协议后违约，可能需要支付违约金或承担其他违约责任。因此，在违约前应权衡利弊，并尽量与用人单位协商解决。

综上所述，三方协议属于民事合同，具有法律效力。在签订和履行过程中，各方应谨慎对待各项条款，以确保自身权益。如果有任何疑问或问题，可以直接向我咨询。