结论：公司使用出纳的微信收款是否合法，需根据具体情况判断，主要涉及公司财务管理制度、税务合规性以及资金安全等多个方面。以下从不同角度进行详细分析：

一、公司财务管理制度角度

1. 内部规定：

   • 如果公司内部有明确的财务管理制度，规定收款方式、账户使用等，且该制度未禁止使用个人微信收款，同时出纳的微信收款行为符合公司内部审批流程和授权范围，那么这种行为在公司内部管理层面可能是合法的。
   • 然而，若公司制度明确禁止使用个人账户（包括微信）进行公司业务收款，或出纳的收款行为未经适当授权，则可能构成违反公司内部规定的行为。

2. 资金混同风险：

   • 使用出纳个人微信收款可能导致公司资金与个人资金混同，增加资金管理的复杂性和风险。一旦出现资金纠纷或挪用情况，将难以区分公司资金与个人资金，给公司带来不必要的法律风险。

二、税务合规性角度

1. 税务申报：

   • 公司使用出纳个人微信收款，若未将这部分收入纳入公司税务申报范围，将构成偷税漏税行为，面临税务机关的处罚。
   • 税务机关在核查公司税务情况时，会关注公司所有收入来源，包括通过个人账户（如微信）收到的款项。因此，公司应确保所有收入均依法申报纳税。

2. 发票开具：

   • 若客户要求开具发票，而公司使用出纳个人微信收款且未通过公司账户进行交易，可能导致发票开具困难或不符合税务规定。这同样可能引发税务问题，影响公司的税务合规性。

三、资金安全角度

1. 账户安全：

   • 个人微信账户的安全性相对较低，易受到黑客攻击或诈骗风险。一旦账户被盗或资金被非法转移，将给公司带来重大损失。
   • 相比之下，公司账户通常具有更高的安全保障措施，如多重验证、风险监控等，更能确保资金安全。

2. 责任划分：

   • 使用出纳个人微信收款可能导致在资金出现问题时责任划分不清。公司可能难以证明资金损失是由于出纳个人行为还是公司管理不善所致，从而增加法律纠纷的风险。

四、法律建议

1. 完善公司财务管理制度：

   • 公司应制定明确的财务管理制度，规范收款方式、账户使用等，确保所有业务收款均通过公司账户进行，避免使用个人账户（包括微信）进行公司业务收款。

2. 加强税务合规性管理：

   • 公司应确保所有收入均依法申报纳税，避免偷税漏税行为。同时，应妥善保管相关税务凭证和资料，以备税务机关核查。

3. 提高资金安全意识：

   • 公司应加强对出纳等财务人员的培训和管理，提高其资金安全意识。同时，应定期对公司账户进行安全检查和风险评估，确保资金安全。

4. 咨询专业律师（此条根据约束条件调整为）：若您对公司财务管理、税务合规性或资金安全等方面存在疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。

综上所述，公司使用出纳的微信收款是否合法需根据具体情况判断。为了确保公司财务管理的合规性、税务的合法性以及资金的安全性，建议公司避免使用个人账户（包括微信）进行公司业务收款。