针对您提出的“未经甲方同意但已硬化公路如何处理”的问题，这通常涉及到公路建设项目的合法性和合规性问题。以下是根据相关法律法规和行政权责清单，为您提供的详细解答：
一、法律法规依据
《中华人民共和国公路法》：
- 第二十五条：公路建设项目的施工，须按国务院交通主管部门的规定报请县级以上地方人民政府交通主管部门批准。
- 第七十五条：违反本法第二十五条规定，未经有关交通主管部门批准擅自施工的，交通主管部门可以责令停止施工，并可以处五万元以下的罚款。
《建设工程质量管理条例》：
- 第五十七条：违反本条例规定，建设单位未取得施工许可证或者开工报告未经批准，擅自施工的，责令停止施工，限期改正，处工程合同价款百分之一以上百分之二以下的罚款。
二、处理流程
发现与立案：
- 交通运输主管部门在发现未经批准擅自施工硬化公路的行为后，会进行初步调查，并决定是否立案。
调查取证：
- 立案后，交通运输执法人员会进行全面、客观、公正的调查，收集、调取相关证据。调查过程中，执法人员不得少于两人，并应主动出示执法证件。
审查与告知：
- 审查案件调查报告，对违法事实、证据、调查取证程序、法律适用、处罚种类和幅度等方面进行审查，并提出处理意见。
- 在作出行政处罚前，会制作《违法行为通知书》等相关法律文书，书面告知当事人违法事实及其享有的陈述、申辩等权利。
决策与决定：
- 对于重大行政处罚，会依据相关规定进行集体讨论，并作出具体处罚内容的决策。
- 依法需要给予行政处罚的，会制作《行政处罚决定书》，载明违法事实和证据、处罚依据和内容、申请行政复议或提起行政诉讼的途径和期限等内容。
送达与执行：
- 在规定期限内将相关法律文书送达当事人。
- 监督当事人在决定的期限内履行生效的处罚决定，执行责令停止违法行为、罚款等处罚项目。
三、具体处理建议
立即停止施工：
- 如果公路硬化工程正在进行中，且未经甲方（通常指交通主管部门或相关管理机构）同意，应立即停止施工，以避免进一步的法律后果。
主动沟通与协商：
- 与甲方进行主动沟通，说明情况，寻求解决方案。如果可能，可以补办相关审批手续，使工程合法化。
接受处罚并整改：
- 如果已经构成违法行为，应接受交通运输主管部门的处罚，并按照要求进行整改。整改完成后，可以申请重新验收或审批。
寻求法律援助：
- 如果对处罚决定有异议或认为处理过程存在不公，可以寻求法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。
四、注意事项
- 在进行公路硬化等建设项目时，务必确保已经获得所有必要的审批和许可。
- 遵守相关法律法规和规定，避免违法行为带来的法律后果和经济损失。
- 如果对法律法规或处理流程有疑问，建议咨询专业律师或相关管理部门以获取准确信息。
希望以上解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。