结论前置：摩托车违反交通信号灯通行，将面临相应的法律处罚，具体包括扣分和罚款。处罚依据和标准主要依据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关法规执行。

一、处罚依据与通用规定

根据《中华人民共和国道路交通安全法》第三十八条，所有车辆，包括摩托车，必须按照交通信号通行。在交通警察现场指挥时，应遵从其指挥；在无交通信号的道路上，则需确保安全、畅通原则下通行。该法第九十条进一步规定，违反道路交通安全法律、法规的通行规定者，将处警告或二十元以上二百元以下罚款，特殊规定除外。

二、具体处罚标准

对于摩托车驾驶人违反交通信号灯通行的行为，处罚标准如下：

1. 扣分：

   • 依据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，不按交通信号灯指示通行的，摩托车驾驶人一次记6分。

2. 罚款：

   • 通常处以200元罚款，但各地可根据实际情况在20元至200元范围内调整。例如，北京、上海等地一般执行上限罚款200元。

三、特殊情况处理

1. 被大车遮挡视线误闯红灯：

   • 若摩托车驾驶人因前方大型车辆遮挡导致误闯红灯，部分地方交警部门在核实情况后可能不会认定为违章。此时，驾驶人需提出申诉并提供证据，如行车记录仪视频等，经调查属实后可撤销处罚。

2. 紧急避险闯红灯：

   • 如摩托车驾驶人为紧急送医、执行紧急任务等特殊原因闯红灯，可提供相关证明（如医院诊断书、任务指令等），向交警部门说明情况。核实后，交警部门可能撤销处罚。

四、法律建议与后果

1. 法律建议：

   • 摩托车驾驶人应严格遵守交通信号灯指示，不仅为了避免法律处罚，更是对自身及他人生命财产安全的负责。
   • 在行驶过程中，应保持与前车的安全距离，避免因视线受阻而误闯红灯。
   • 如遇特殊情况需闯红灯，应尽可能保留相关证据，以便后续申诉。

2. 可能的法律后果：

   • 违反交通信号灯通行不仅可能导致扣分和罚款，还可能引发交通事故，造成人员伤亡和财产损失。
   • 在交通事故中，违反交通信号灯通行的摩托车驾驶人可能需承担主要或全部责任，面临更严重的法律后果。

五、总结

摩托车违反交通信号灯通行是严重的交通违法行为，将面临扣分和罚款的处罚。驾驶人应严格遵守交通规则，确保行车安全。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。