结论：根据相关法律法规，土地被征用后若连续两年未使用，一般可以由县级以上人民政府无偿收回，但具体操作需遵循法定程序，并考虑合同内容和当地政府政策。
法律背景与详细解释：
《中华人民共和国土地管理法》的相关规定：
- 该法第三十八条明确禁止任何单位和个人闲置、荒芜耕地。对于已经办理审批手续的非农业建设占用耕地，若一年以上未动工建设，需按照省、自治区、直辖市的规定缴纳闲置费；连续二年未使用的，经原批准机关批准，县级以上人民政府可无偿收回用地单位的土地使用权。若该幅土地原为农民集体所有，则应交由原农村集体经济组织恢复耕种。
《中华人民共和国城市房地产管理法》的相关规定：
- 该法第二十六条针对以出让方式取得土地使用权进行房地产开发的情况作出规定，若超过出让合同约定的动工开发日期满一年未动工开发，可以征收相当于土地使用权出让金百分之二十以下的土地闲置费；满二年未动工开发的，除因不可抗力或者政府、政府有关部门的行为或者动工开发必需的前期工作造成动工开发迟延的除外，可以无偿收回土地使用权。
实际操作与法律程序：
- 收回土地使用权并非随意进行，而是需要按照法定程序，包括经过原批准机关的批准等一系列流程。这意味着，即使土地连续两年未使用，也不能直接自行收回，而必须通过法律途径并遵循相关程序。
合同内容与政府政策的影响：
- 在某些情况下，尽管土地未使用，但政府可能出于未来规划的需要而保留该土地。此外，具体的合同内容也可能对土地的使用和收回产生约束。例如，合同中可能规定了土地使用的特定条件或期限，以及未使用时的处理方式等。因此，在处理此类问题时，还需综合考虑合同的具体条款和当地政府的政策导向。
法律建议与可能后果：
- 对于被征地者：如果发现土地被征用后长时间未使用，且怀疑存在闲置情况，可以向当地土地管理部门反映情况，并要求其进行调查核实。若确实存在闲置情况，土地管理部门将依法采取相应措施，如征收闲置费或无偿收回土地使用权等。
- 对于土地使用者：应严格遵守土地使用合同和相关法律法规的规定，按时动工开发土地，避免土地闲置。若因特殊原因无法按时开发，应及时向相关部门申请延期或采取其他合法措施，以避免承担法律责任。
- 可能后果：若土地使用者未按时开发土地且未采取合法措施，可能面临土地被无偿收回的风险。同时，还可能被征收土地闲置费等经济处罚。
总结：土地被征用后若连续两年未使用，一般可以由县级以上人民政府无偿收回，但具体操作需遵循法定程序，并考虑合同内容和当地政府政策。在处理此类问题时，建议被征地者和土地使用者都应积极了解相关法律法规和政策规定，以维护自身合法权益。若有问题，可以直接向我咨询。