学校查到学生使用盖有医院假章的文件或证明，这是一个非常严肃的问题，因为这涉及到伪造公文、证件或印章的违法行为。以下是我对这个问题的详细解答：
一、法律后果
行政处罚：根据相关法律法规，伪造、变造或者使用伪造、变造的公文、证件、印章的，可能会受到行政处罚，如罚款、拘留等。具体处罚力度会根据违法情节的严重程度来决定。
刑事责任：如果伪造、变造或使用假章的行为情节严重，构成犯罪的，还将依法追究刑事责任。这可能包括有期徒刑、罚金等严厉的刑罚。
二、学校处理
纪律处分：学校作为教育机构，对于学生的违法行为有明确的纪律处分规定。一旦发现学生使用假章，学校可能会根据校规校纪给予相应的纪律处分，如警告、记过、留校察看甚至开除学籍等。
影响学业和未来发展：使用假章不仅可能面临法律和学校的双重处罚，还会对学生的学业和未来发展产生严重影响。例如，可能影响学生的毕业、升学、就业等，甚至可能留下不良记录，影响个人声誉。
三、建议与措施
立即停止使用假章：如果学生已经使用了假章，应立即停止这种行为，并主动向学校或相关部门说明情况，争取从轻处理。
积极配合调查：在面对学校或相关部门的调查时，学生应积极配合，如实陈述事实，提供相关证据，以便尽快查明真相，减少不良影响。
增强法律意识：学生应增强法律意识，了解伪造公文、证件或印章的严重后果，自觉遵守法律法规和学校规章制度。
寻求合法途径解决问题：如果学生需要医院出具相关证明或文件，应通过合法途径向医院申请，并按照规定程序办理。切勿因一时之便而走上违法道路。
四、案例警示
近年来，公安机关依法严厉打击各类伪造变造买卖国家公文证件印章违法犯罪行为，并通报了多起典型案例。这些案例表明，伪造公文、证件或印章的行为不仅违法，而且后果严重。因此，学生应引以为戒，切勿以身试法。
总之，学校查到学生使用盖有医院假章的文件或证明时，会依法依规进行处理。学生应增强法律意识，自觉遵守法律法规和学校规章制度，避免走上违法道路。