若在破产程序中已签订以物抵债协议，其效力及处理方式需根据协议签订时间和破产程序阶段综合判断，具体如下：

1. 破产申请受理前签订的以物抵债协议
   根据《企业破产法》第32条，若协议签订于法院受理破产申请前6个月内，且债务人已具备破产原因（如不能清偿到期债务且资产不足以清偿全部债务），管理人有权请求法院撤销该协议。此时协议可能被认定无效，债权人需通过破产程序申报债权，按法定清偿顺序受偿。
   例外情形：若债权人能证明债务人签订协议时无恶意逃债目的（如正常商业对价、已实际履行部分义务），可能不被撤销，但需承担举证责任。

2. 破产申请受理后签订的以物抵债协议
   根据《企业破产法》第16条，法院受理破产申请后，债务人对个别债权人的债务清偿无效。此时以物抵债协议因违反强制性规定而无效，债权人需立即停止履行协议，并向管理人申报债权。管理人将根据《企业破产法》第113条规定的清偿顺序（职工债权→税收债权→普通债权）分配财产，普通债权人通常按比例受偿。

3. 协议已履行完毕的特殊情形
   若协议在破产申请受理前已实际履行（如财产已过户、交付），且无恶意串通损害其他债权人利益的情形，根据《民法典》第557条，协议因履行完毕而终止，债权人可保留抵债财产。但若管理人能证明债务人存在低价转让、偏袒性清偿等行为，仍可依据《企业破产法》第31-33条行使撤销权，追回财产纳入破产财产分配。

实务建议：

• 若您是债权人，发现债务人可能进入破产程序，应立即停止履行以物抵债协议，并要求债务人提供担保或通过诉讼确认债权；
  
• 若您是债务人，需避免在破产临界期内签订以物抵债协议，否则可能面临管理人追责；
  
• 协议签订前，建议通过企业信用信息公示系统查询债务人涉诉、执行信息，评估其破产风险。
  

如有具体协议文本或案件细节，可进一步向我提供，我将结合条款内容为您分析风险点。