若一方在合同纠纷中提交虚假协议，而另一方持有相关证据，可采取以下法律措施：

1. 证据固定与提交：

   • 首先，确保你手中的证据是合法、真实且与案件直接相关的。这可能包括但不限于原始协议文本、电子邮件、短信记录、录音录像、证人证言等，能够证明对方提交的协议是虚假的。
   • 将这些证据进行整理、编号，并在法庭上或调解过程中适时提交，以支持你的主张。

2. 申请司法鉴定：

   • 如果协议的真实性存在争议，你可以向法院申请对协议进行司法鉴定，如笔迹鉴定、打印时间鉴定等，以确定协议的真实性和形成时间。
   • 司法鉴定结果通常具有较高的证明力，能够作为法院裁判的重要依据。

3. 提出抗辩与反诉：

   • 在诉讼过程中，你可以针对对方提交的虚假协议提出抗辩，说明该协议并非双方真实意思表示，因此不具有法律效力。
   • 如果对方的行为给你造成了损失，你还可以考虑提出反诉，要求对方承担因提交虚假协议而给你造成的损失赔偿责任。

4. 请求法院制裁：

   • 根据《民事诉讼法》的相关规定，如果一方当事人故意提交虚假证据，妨碍人民法院审理案件的，人民法院可以根据情节轻重予以罚款、拘留；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
   • 你可以向法院提出申请，要求对提交虚假协议的一方进行制裁。

5. 考虑和解或调解：

   • 在诉讼过程中，如果双方都有和解或调解的意愿，你可以考虑与对方进行协商，寻求达成和解或调解协议。
   • 和解或调解可以节省时间和成本，避免进一步的法律纠纷，但前提是确保你的权益得到充分保障。

法律后果与风险提示：

• 如果对方提交的虚假协议被法院认定无效，那么该协议将不会对双方产生法律约束力。
• 提交虚假协议的一方可能面临法律制裁，包括罚款、拘留甚至刑事责任。
• 作为持有证据的一方，你需要确保证据的合法性和真实性，避免在诉讼过程中因证据问题而陷入被动。

建议行动步骤：

1. 立即整理并固定你手中的证据，确保其完整性和真实性。
2. 咨询专业律师（即我，张超律师），对你的案件进行全面评估，并制定合适的诉讼策略。
3. 根据律师的建议，适时向法院提交证据，申请司法鉴定，并提出抗辩与反诉。
4. 密切关注案件进展，及时与律师沟通，确保你的权益得到充分保障。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。