在合法经营的前提下，是否扣除成本费用取决于具体的经营行为、合同约定以及相关法律法规的规定，不能一概而论。以下从几个不同角度进行分析：
一、从会计核算与税务处理的角度
会计核算原则：
- 在会计核算中，企业应当遵循权责发生制原则，合理确认和计量各项收入和费用。成本费用是企业为取得收入而发生的资源耗费，应当在发生时按照其受益期进行分摊和确认。
- 因此，在合法经营的情况下，企业应当根据实际发生的成本费用进行会计核算，以准确反映企业的财务状况和经营成果。
税务处理规定：
- 根据税法规定，企业在计算应纳税所得额时，可以扣除与取得收入有关的、合理的成本、费用、税金、损失和其他支出。
- 这意味着，在合法经营的前提下，企业有权在税务处理中扣除符合规定的成本费用，以降低税负。
二、从合同约定的角度
合同条款的约定：
- 在商业合同中，双方通常会就成本费用的承担进行明确约定。例如，在买卖合同中，可能会约定买方承担运输费用、保险费用等额外成本。
- 因此，在合法经营的情况下，企业应当按照合同约定来承担或扣除成本费用。如果合同中有明确约定，则应当遵循合同约定执行。
合同解释与争议解决：
- 如果合同中对成本费用的承担约定不明确或存在争议，双方应当通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决争议。
- 在解决争议时，法院或仲裁机构会根据合同的具体条款、交易习惯、公平原则等因素来综合判断成本费用的承担方。
三、从法律法规的强制性规定角度
法律法规的禁止性规定：
- 某些法律法规可能对成本费用的扣除有明确的禁止性规定。例如，税法中可能规定某些特定类型的费用不得在税前扣除。
- 在合法经营的情况下，企业必须遵守这些法律法规的强制性规定，不得擅自扣除被禁止的成本费用。
法律法规的鼓励性政策：
- 另一方面，某些法律法规也可能出台鼓励性政策，允许企业在特定条件下扣除更多的成本费用。例如，为了鼓励企业进行研发创新，税法可能规定研发费用可以在税前加计扣除。
- 在这种情况下，企业可以充分利用这些鼓励性政策来降低税负。
四、实际操作中的建议
完善合同条款：
- 在签订合同时，双方应当尽可能明确约定成本费用的承担方式和范围，以避免后续争议。
遵守法律法规：
- 企业应当严格遵守相关法律法规的规定，不得擅自扣除被禁止的成本费用或违反其他强制性规定。
合理利用政策：
- 企业应当关注并合理利用国家出台的鼓励性政策，以降低税负并提高经济效益。
寻求专业咨询：
- 如果企业在成本费用扣除方面存在疑问或争议，建议寻求专业律师或税务师的咨询和帮助，以确保合法合规地处理相关问题。
总结来说，在合法经营的前提下，企业是否扣除成本费用需要根据具体的经营行为、合同约定以及相关法律法规的规定来综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。