结论：保险公司是否赔偿，需根据保险合同具体条款、事故原因及是否存在免责情形综合判断，以下分情况说明：

1. 若驾驶员故意纵火或存在重大过失

根据《保险法》及多数商业车险条款，故意行为或重大过失导致的损失属于免责范围。例如：

• 驾驶员因纠纷故意纵火；
  
• 严重违反操作规程（如车内放置易燃物导致自燃）。
  保险公司通常拒赔，车主可向驾驶员追偿损失。

2. 若事故因车辆自燃且无人为因素

若车辆因自身故障（如电路老化、油路泄漏）引发自燃，且车主投保了自燃险（附加险），则保险公司需赔偿。但需注意：

• 自燃险需单独购买，非车损险默认覆盖范围；
  
• 保险公司可能要求提供消防部门出具的《火灾事故认定书》，证明非人为因素。

3. 若事故因第三方原因导致

例如：

• 其他车辆碰撞引发火灾；
  
• 第三方故意纵火。
  此时需通过车损险（覆盖碰撞、火灾等意外）或第三者责任险（对方责任）索赔。若对方逃逸或无力赔偿，车主可申请“代位求偿”，由保险公司先行赔付后向责任方追偿。

4. 关键免责情形提示

保险公司可能拒赔的常见情形包括：

• 车辆未年检或存在安全隐患；
  
• 驾驶员无证驾驶、酒驾、毒驾；
  
• 战争、暴乱等不可抗力（需合同明确约定）。

行动建议

1. 立即报案：保留现场照片、消防证明、警方记录等证据；
   
2. 核对保单：确认是否投保自燃险、车损险及免责条款；
   
3. 协商或诉讼：若保险公司拒赔，可向银保监会投诉或通过法律途径解决。
   

如有进一步细节（如保险类型、事故原因等），可随时补充说明，我会为您具体分析。