公司股权在以下情况下通常不能进行变更登记：

1. 法律程序未履行完毕：

   • 股权转让协议存在争议或无效：如果股权转让协议本身存在争议，如因欺诈、胁迫、显失公平等原因被撤销或认定无效，那么在此情况下，股权变更登记自然无法进行。此外，若协议内容违反法律法规的强制性规定，如违反公司章程、损害其他股东优先购买权等，也可能导致股权转让无效，从而无法办理变更登记。
   • 未获得必要的批准或同意：根据公司法及相关规定，某些股权转让需要获得公司其他股东的同意或相关政府部门的批准。例如，外商投资企业的股权转让可能需要获得商务部门的批准；国有股权转让可能需要获得国有资产监督管理机构的批准。若未获得这些必要的批准或同意，股权变更登记将无法进行。

2. 公司内部程序未完成：

   • 未召开股东会或股东大会：对于需要股东会或股东大会决议的股权转让事项，若未召开相关会议或会议未形成有效决议，那么股权变更登记将无法进行。
   • 未修改公司章程：股权转让后，公司章程中关于股东名册、股权比例等事项需要相应修改。若未修改公司章程或未办理相关备案手续，也可能影响股权变更登记的进行。

3. 存在法律纠纷或限制：

   • 股权被冻结或查封：若股权因诉讼、仲裁等原因被法院冻结或查封，那么在此期间股权将无法进行变更登记。
   • 存在其他法律限制：如股权转让受到竞业限制、保密义务等法律条款的约束，若违反这些条款进行股权转让，也可能导致股权变更登记无法进行。

4. 登记材料不齐全或不符合规定：

   • 提交材料不完整：办理股权变更登记需要提交一系列材料，如股权转让协议、公司章程修正案、股东会或股东大会决议等。若提交的材料不完整或存在瑕疵，将导致股权变更登记无法进行。
   • 材料不符合规定：除了完整性外，提交的材料还需要符合相关法律法规和登记机关的规定。例如，股权转让协议需要双方签字盖章、公司章程修正案需要符合公司法等相关法律法规的规定等。若材料不符合规定，也将影响股权变更登记的进行。

法律建议：

• 在进行股权转让前，务必确保股权转让协议合法有效，并履行了所有必要的法律程序和公司内部程序。
• 关注股权是否存在被冻结、查封或其他法律限制的情况，避免因此导致股权变更登记无法进行。
• 准备齐全且符合规定的登记材料，确保股权变更登记的顺利进行。

若你在公司股权变更登记过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。