买受人对房屋合同有异议时，确实可以直接在合同上标注对哪个条款有异议，但这种方式并非最佳或最正式的解决途径。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

一、直接标注异议的可行性

1. 合同修改与补充：从合同法的角度来看，合同是双方意思表示一致的产物，如果买受人对合同中的某些条款有异议，理论上可以在合同上直接标注并尝试与出卖人协商修改。然而，这种方式在实际操作中可能并不便捷，因为合同的修改通常需要双方正式签署补充协议或修改条款，以确保修改的合法性和有效性。

2. 标注的效力问题：直接在合同上标注异议，并不意味着该标注就具有法律效力。除非双方都认可这种标注方式，并明确表示愿意受其约束，否则这种标注可能只是买受人单方面的意思表示，无法对出卖人产生法律约束力。

二、更正式的解决途径

1. 协商修改：买受人与出卖人应就合同中的异议条款进行协商，尝试达成一致意见并修改合同。这种方式既体现了双方的意愿，又确保了合同的合法性和有效性。

2. 签订补充协议：如果双方就修改合同达成一致，可以签订补充协议来明确修改的内容。补充协议与原合同具有同等法律效力，是解决合同异议的一种正式且有效的方式。

3. 法律途径：如果双方无法就合同异议达成一致，买受人可以考虑通过法律途径来解决争议。例如，可以向法院提起诉讼或申请仲裁，要求法院或仲裁机构对合同条款进行解释或裁决。

三、实际操作建议

1. 保留证据：无论采取哪种方式解决合同异议，买受人都应保留好相关证据，如合同原件、异议标注的复印件、协商记录等。这些证据在后续的法律程序中可能起到关键作用。

2. 寻求专业帮助：由于合同纠纷可能涉及复杂的法律问题，买受人在处理合同异议时可以考虑寻求专业律师的帮助。律师可以提供专业的法律意见和协助，帮助买受人更好地维护自己的权益。

总结来说，虽然买受人可以直接在合同上标注对哪个条款有异议，但这种方式并非最佳或最正式的解决途径。更推荐的方式是与出卖人协商修改合同或签订补充协议，并在必要时寻求专业律师的帮助。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。