结论：法院协商还款后，还款几期后因事过了还款日两天，一般不会直接取消协议，但具体是否取消协议需视协议内容、逾期原因及双方协商情况而定。

分析说明：

1. 协议内容：

   • 法院协商还款通常涉及一份还款协议，该协议会明确还款期限、还款金额、逾期后果等关键条款。
   • 如果协议中明确规定了逾期超过一定天数（如两天）即视为违约，且违约后协议自动终止或需承担特定后果，那么过了还款日两天可能触发协议中的违约条款，导致协议取消或需承担违约责任。
   • 如果协议中未明确规定逾期两天的后果，或者规定了较为宽松的逾期处理方式（如给予一定的宽限期），则一般不会直接取消协议。

2. 逾期原因：

   • 逾期还款的原因也是判断协议是否会被取消的重要因素。如果逾期是由于不可抗力（如自然灾害、突发疾病等）或对方同意的合理事由导致的，且借款人能够及时与债权人沟通并说明情况，那么协议通常不会被轻易取消。
   • 如果逾期是由于借款人故意拖延或无正当理由导致的，那么债权人可能会根据协议条款或法律规定要求取消协议或采取其他法律措施。

3. 双方协商：

   • 在出现逾期情况后，双方应积极沟通并协商解决方案。如果借款人能够主动与债权人联系并说明逾期原因，同时提出合理的还款计划或补救措施，那么债权人可能会考虑给予一定的宽限期或调整还款计划，从而避免协议被取消。
   • 如果双方无法就逾期问题达成一致意见，或者借款人拒绝履行还款义务，那么债权人可能会根据协议条款或法律规定向法院申请强制执行或采取其他法律措施。

法律建议：

• 仔细阅读协议：借款人应仔细阅读还款协议中的各项条款，特别是关于逾期还款的后果和违约责任的规定，以确保自己了解并遵守协议要求。
• 及时沟通：如果出现逾期情况，借款人应尽快与债权人联系并说明原因，同时提出合理的还款计划或补救措施，以争取债权人的理解和支持。
• 寻求法律帮助：如果双方无法就逾期问题达成一致意见，或者借款人认为债权人的要求不合理或存在违法行为，可以寻求专业律师的法律帮助，以维护自己的合法权益。

可能后果：

• 如果协议被取消或借款人被认定为违约，借款人可能需要承担违约责任，包括支付违约金、赔偿损失等。
• 债权人有权根据协议条款或法律规定向法院申请强制执行借款人的财产或采取其他法律措施来追讨欠款。