不可以直接以总包不回款为由不付乙方款项。在建设工程合同纠纷中，总包与乙方（通常指分包商或供应商）之间的付款关系是基于双方签订的合同来确定的。以下从几个方面进行详细分析：
一、合同相对性原则
根据合同法的相关规定，合同具有相对性，即合同只对签订合同的双方具有约束力。总包与发包人（业主）之间的合同关系，以及总包与乙方之间的合同关系，是两个独立的法律关系。总包不能因为与发包人之间的纠纷（如发包人未按时支付工程款），而直接拒绝向乙方支付款项。
二、乙方权益保护
合同约定：如果总包与乙方之间的合同中明确规定了付款条件、付款时间等条款，总包应当按照合同约定履行付款义务。若总包未按时支付，乙方有权依据合同要求总包支付款项，并可能要求总包承担违约责任。
法律救济：如果总包拒绝支付，乙方可以通过法律途径维护自己的权益，如向法院提起诉讼或申请仲裁，要求总包支付款项及可能的违约金、利息等。
三、总包可能面临的法律后果
违约责任：总包未按照合同约定支付款项，构成违约行为，应当承担违约责任。这可能包括支付违约金、赔偿乙方因此遭受的损失等。
信用受损：总包的不诚信行为可能影响其商业信誉，进而影响其未来的业务合作和市场竞争力。
四、特殊情况下的处理
当然，也存在一些特殊情况，如总包与乙方之间的合同中明确约定了“背靠背”条款（即总包向乙方支付款项的条件是发包人已向总包支付相应款项）。在这种情况下，如果发包人确实未向总包支付款项，且总包能够提供充分证据证明这一点，那么总包可能暂时无需向乙方支付款项。但即便如此，总包也应当积极与发包人沟通协商，尽快解决付款问题，以避免对乙方造成不必要的损失。
五、建议
审查合同：总包和乙方都应当仔细审查合同条款，明确各自的权利和义务，以及付款条件和时间等关键信息。
沟通协商：在出现付款纠纷时，双方应当积极沟通协商，寻求妥善解决方案。避免因为沟通不畅或处理不当而导致纠纷升级。
法律途径：如果协商无果，双方可以通过法律途径维护自己的权益。在诉讼或仲裁过程中，双方应当提供充分证据证明自己的主张。
总结来说，总包不能直接以发包人未回款为由不付乙方款项。双方应当依据合同约定和法律规定来处理付款纠纷，以维护各自的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。