合同一方两年后补签名，在符合一定条件下是可以进行笔迹鉴定的。以下从多个角度进行分析：

1. 笔迹鉴定的可行性：

   • 笔迹鉴定是通过对比书写人笔迹特征的一致性来判断是否为同一人书写。即使签名是在两年后补签，只要能够获取到书写人同期或相近时期的笔迹样本，以及补签时的笔迹样本，就有可能通过专业的笔迹鉴定机构进行鉴定。
   • 笔迹鉴定并不受时间跨度的绝对限制，但时间越长，书写人的书写习惯可能因各种因素（如年龄、健康状况、书写工具的变化等）而发生变化，这可能会增加鉴定的难度。

2. 影响鉴定结果的因素：

   • 样本质量：用于鉴定的样本必须清晰、完整，能够反映出书写人的笔迹特征。如果样本质量不佳，如模糊、残缺或受到污染，将影响鉴定结果的准确性。
   • 样本数量：提供足够数量的样本有助于鉴定机构更准确地把握书写人的笔迹特征，从而提高鉴定的可靠性。
   • 书写条件：补签时的书写条件（如纸张、笔墨、书写姿势等）应与原始签名时的条件尽可能相似，以减少因书写条件差异导致的笔迹变化。
   • 鉴定机构的专业性：选择具有专业资质和丰富经验的笔迹鉴定机构进行鉴定，是确保鉴定结果准确性的关键。

3. 法律程序中的考量：

   • 在法律程序中，笔迹鉴定结果通常作为证据使用。因此，在进行笔迹鉴定前，应确保鉴定程序的合法性和正当性，以避免因鉴定程序瑕疵导致鉴定结果不被采纳。
   • 如果合同双方对补签名的真实性存在争议，且无法通过协商解决，可以考虑通过法律途径解决。在诉讼过程中，可以向法院申请笔迹鉴定，由法院指定或双方协商确定鉴定机构进行鉴定。

4. 实际操作建议：

   • 如果需要对两年后补签的合同进行笔迹鉴定，建议尽快收集书写人同期或相近时期的笔迹样本，以及补签时的笔迹样本。
   • 选择具有专业资质和良好信誉的笔迹鉴定机构进行鉴定，并确保鉴定过程符合法律程序要求。
   • 在鉴定结果出来后，根据鉴定结果采取相应的法律措施，如确认合同效力、追究违约责任等。