结论：法院判决履行款单位没有对公账户，而要求汇入财政账户并已注明用途，这一行为是否合法，需结合具体情况判断，但在符合相关财务和法律规定的条件下，该行为是合法的。以下从多个角度进行分析：
一、单位没有对公账户的情况
单位性质与财务规定：
- 某些单位，特别是非营利性组织或政府机构，可能并未设立对公账户，而是使用财政账户进行资金管理。
- 在这种情况下，单位要求将法院判决履行款汇入财政账户，是符合其财务管理规定的。
法律合规性：
- 单位使用财政账户接收款项，需确保该行为符合相关法律法规的规定，如《中华人民共和国预算法》、《中华人民共和国会计法》等。
- 单位应确保财政账户的使用符合其设立目的和财务管理要求，不得违规使用或挪用资金。
二、汇入财政账户并注明用途的合法性
用途明确性：
- 单位在要求汇入财政账户时，已注明款项用途，这有助于确保资金的透明度和合规性。
- 明确的用途说明可以防止资金被挪用或滥用，保护债权人的合法权益。
法律程序与要求：
- 单位应确保汇入财政账户的行为符合法院判决的要求和执行程序。
- 如果法院判决中明确指定了履行款的支付方式和账户，单位应遵守该判决，除非有合法理由并经过法院同意进行变更。
三、可能存在的风险与注意事项
资金安全风险：
- 尽管单位要求汇入财政账户并注明用途，但仍需关注资金的安全问题。
- 债权人应确保款项确实汇入了指定的财政账户，并保留好相关汇款凭证和用途说明。
法律合规性审查：
- 在进行汇款前，债权人或单位应咨询专业律师或财务顾问，确保该行为符合相关法律法规的规定。
- 如果对法律合规性存在疑问，应及时向相关部门或法院进行咨询和确认。
后续执行与监督：
- 单位应确保汇入财政账户的款项按照注明用途进行使用，并接受相关部门的监督和审计。
- 如果单位未按照约定用途使用款项，债权人可以向法院申请强制执行或采取其他法律措施维护自己的权益。
建议：在实际操作中，如果单位没有对公账户而要求将法院判决履行款汇入财政账户，并已注明用途，债权人应谨慎处理。在确保资金安全的前提下，可以咨询专业律师或财务顾问的意见，确保该行为符合相关法律法规的规定。如果有任何疑问或担忧，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。