结论：没有结婚证办房产证交税时是否要写协议，需分情况讨论，主要取决于房产的出资情况、产权归属意愿等因素，以下为你详细分析：

1. 双方共同出资购房，希望明确产权份额
   • 情况说明：若双方虽然没有结婚证，但共同出资购买房产，并且希望在房产证上体现各自的产权份额，或者为了避免日后可能出现的产权纠纷，那么签订一份协议是非常有必要的。
   • 协议作用：这份协议可以明确双方对房产的出资比例、产权归属、使用权益、处分权益等重要事项。例如，约定一方出资 70%，另一方出资 30%，房产产权按照出资比例共有；或者约定房产归一方所有，另一方的出资视为借款等。
   • 交税影响：在办理房产证和交税时，税务部门主要关注的是房产的交易价格、产权归属等与税收计算相关的因素。签订的协议本身不会直接影响交税的金额，但如果协议中约定的产权归属等情况与实际登记情况不一致，可能会在后续的房产处置（如转让、继承等）时影响税收的计算和缴纳。
2. 一方单独出资购房，另一方不涉及产权
   • 情况说明：如果房产是由一方单独出资购买，另一方没有出资且不要求拥有房产产权，那么从产权登记和交税的角度来看，一般不需要签订协议。
   • 操作方式：单独出资方可以直接以自己的名义办理房产证，并按照相关规定缴纳相应的税费，如契税、印花税等。税务部门会根据房产的交易价格、面积等因素计算应缴纳的税款。
   • 特殊情况：不过，如果出资方希望给予另一方一定的经济补偿或其他权益，或者为了避免日后可能出现的纠纷，也可以签订一份协议，明确双方的权利和义务。但这种协议主要是为了保障双方的权益，与办理房产证和交税的直接关系不大。
3. 涉及赠与或借贷等特殊情况
   • 赠与情况：如果一方将房产赠与另一方，即使没有结婚证，也需要签订赠与协议。赠与协议要明确赠与的房产信息、赠与的条件（如有）、双方的权利和义务等内容。在办理房产证时，需要按照赠与的相关规定缴纳税费，如契税（一般为 3% - 5%，具体税率根据地区和房产情况而定）、印花税等。
   • 借贷情况：若一方出资购房，另一方的出资视为借款，那么双方需要签订借款协议。借款协议要明确借款金额、利息（如有）、还款期限等重要条款。这种情况主要涉及的是借贷关系，与房产证的办理和房产交税的直接关联较小，但在处理房产时可能会因借贷关系产生一些复杂情况，需要提前做好规划和约定。

建议：在实际操作中，为了确保自身的合法权益，避免日后可能出现的纠纷，无论是否签订协议，都建议在办理房产证和交税等相关事宜前，咨询当地的房产管理部门和税务部门，了解具体的政策和要求。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。