结论：银行卡的钱被司法冻结后，不一定会被直接扣除，这取决于冻结的原因、法律程序以及相关法律文书的执行情况。
详细分析：
冻结原因与法律程序：
- 银行卡被司法冻结，通常是因为涉及法律纠纷，如债务纠纷、合同违约、刑事案件等。司法机关（如法院、检察院）会根据相关法律程序，对涉案人员的银行账户进行冻结，以防止资金转移或隐匿。
- 冻结程序一般包括：司法机关出具冻结令或裁定书，银行根据法律文书执行冻结操作。在此过程中，银行只是执行机构，不参与冻结原因的判断或法律文书的制作。
冻结后的资金处理：
- 冻结不等于划扣：冻结只是限制了账户内资金的流动，即不能进行转账、取款等操作，但并不意味着资金会被直接划扣给债权人或相关机构。
- 划扣需法律文书：如果要将冻结的资金划扣给债权人或相关机构，司法机关需要出具划扣令或执行裁定书等法律文书。银行在收到这些法律文书后，才会执行划扣操作。
- 划扣条件：划扣通常发生在债务纠纷中，当债务人未履行生效法律文书确定的义务时，债权人可以向法院申请强制执行，法院在审查后认为符合划扣条件的，会出具划扣令。
特殊情况：
- 刑事案件中的赃款追缴：在刑事案件中，如果冻结的资金被认定为赃款或违法所得，司法机关可能会直接划扣这些资金用于退赔受害人或上缴国库。
- 保全措施与执行措施的区别：冻结有时是作为保全措施使用的，即在诉讼过程中为了防止被告转移财产而采取的临时措施。如果诉讼结束后被告胜诉或未被判决承担责任，冻结的资金应当解冻并返还给被告。而划扣则通常是在执行阶段进行的，即被告未履行生效法律文书确定的义务时。
法律建议：
- 如果您的银行卡被司法冻结，首先应当了解冻结的原因和法律程序。您可以向冻结机关（如法院、检察院）咨询相关情况，并要求他们出具冻结令或裁定书等法律文书。
- 如果您认为冻结有误或存在其他争议，可以及时向冻结机关提出异议或申请复议。在异议或复议期间，冻结措施可能会暂时停止执行。
- 如果冻结的资金确实需要被划扣，您应当配合司法机关的工作，并按照法律程序履行相关义务。如果您对划扣有异议或认为划扣金额有误，可以及时向司法机关提出申诉或申请执行异议。
后续行动建议：
- 密切关注冻结机关的通知和要求，及时了解冻结和划扣的最新进展。
- 保留好所有与冻结和划扣相关的法律文书和证据材料，以备不时之需。
- 如有需要，可以寻求专业律师的帮助，以更好地维护自己的合法权益。
希望以上分析能对您有所帮助。如果您有任何其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。