结论：结清证明出具后双方约定互不就合同条款事项追诉对方且合同作废的情况下，一般不能再依据原合同起诉，但也存在例外情形。以下为你详细分析：

一般情况：不能再依据原合同起诉

当双方在结清证明中明确约定“互不就合同条款事项追诉对方，合同作废”，这属于双方对合同权利义务的最终清算和了结，具有法律效力。从合同法律关系的角度来看，这意味着双方已经就合同履行过程中的所有事项达成了一致，放弃了基于原合同向对方主张权利的可能性。

例如，甲乙双方签订了一份买卖合同，甲向乙购买一批货物，乙交付货物后，甲支付了货款。之后双方出具结清证明，约定“双方互不就本次买卖合同条款事项追诉对方，本合同作废”。在这种情况下，如果之后甲发现货物存在质量问题，由于双方已经在结清证明中明确放弃了追诉权利，甲一般不能再依据原买卖合同向乙主张违约责任等权利。

存在例外情形可以再起诉

1. 存在欺诈、胁迫等情形：如果一方在签订结清证明时存在欺诈、胁迫等行为，导致另一方在违背真实意思的情况下出具了结清证明，那么受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构撤销该结清证明。一旦结清证明被撤销，原合同的效力将恢复，受损害方就可以依据原合同向对方主张权利。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第一百四十八条规定，一方以欺诈手段，使对方在违背真实意思的情况下实施的民事法律行为，受欺诈方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。第一百五十条规定，一方或者第三人以胁迫手段，使对方在违背真实意思的情况下实施的民事法律行为，受胁迫方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。
   • 举例说明：甲在与乙签订结清证明时，乙故意隐瞒货物存在严重质量问题的事实，甲基于对货物质量的错误认识出具了结清证明。后来甲发现了乙的欺诈行为，甲就可以向法院申请撤销该结清证明，然后依据原合同向乙主张权利。
2. 结清证明存在重大误解：如果一方对结清证明的内容存在重大误解，导致其作出了与真实意思不符的意思表示，那么该方也有权请求人民法院或者仲裁机构撤销结清证明。撤销后，同样可以依据原合同主张权利。
   • 法律依据：《中华人民共和国民法典》第一百四十七条规定，基于重大误解实施的民事法律行为，行为人有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。
   • 举例说明：甲和乙在签订结清证明时，甲误以为乙已经完全履行了合同中的所有义务，但实际上乙还有部分义务未履行。甲基于这种重大误解出具了结清证明，后来甲发现了真实情况，就可以申请撤销结清证明，然后依据原合同要求乙继续履行义务。
3. 涉及第三方权益：如果原合同的履行涉及到第三方的权益，而结清证明的签订损害了第三方的合法权益，那么第三方有权主张结清证明无效，此时原合同的效力可能会受到影响，相关方也可能需要依据原合同处理纠纷。
   • 举例说明：甲和乙签订了一份建设工程合同，丙是该工程材料的供应商。甲和乙在结清证明中约定不再追究对方任何责任，但该结清证明的签订导致丙的材料款无法得到支付，损害了丙的合法权益。丙可以主张该结清证明无效，甲和乙可能需要依据原建设工程合同处理与丙之间的材料款纠纷。

建议：如果你遇到了类似的情况，首先要仔细审查结清证明的签订过程和内容，判断是否存在上述可以撤销或主张无效的情形。如果存在，及时收集相关证据，向人民法院或者仲裁机构提起诉讼或申请仲裁，以维护自己的合法权益。如果你还有其他疑问，可以直接向我咨询。