村民完全有权对村集体土地耕地被侵占的行为进行控告。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律依据
《中华人民共和国民法典》：该法保护民事主体的财产权利，包括土地权益。任何侵占集体土地的行为，都违反了民法典中关于物权保护的相关规定，村民有权要求侵占者停止侵害、恢复原状、赔偿损失。
《中华人民共和国土地管理法》：该法明确规定了土地的所有权和使用权，以及土地的保护和管理。集体土地属于农村集体组织成员共同所有，受法律严格保护。侵占集体土地的行为，将受到法律的制裁。
《中华人民共和国农村土地承包法》（针对可能涉及的承包地侵占）：若侵占行为涉及农村土地承包经营权，该法也提供了相应的法律保护。国家机关及其工作人员有利用职权干涉农村土地承包经营等侵害土地承包经营权、土地经营权的行为，给承包经营当事人造成损失的，应当承担损害赔偿等责任。
二、控告途径与步骤
收集证据：
- 土地权属证明文件，如集体土地所有权证、土地使用权证等；
- 现场照片、视频资料，直观展示侵占现状；
- 证人证言，包括目击者陈述、相关知情人士的证词；
- 其他能证明侵占行为的材料，如书面警告、沟通记录等。
向行政部门反映：
- 向当地的国土资源管理部门或乡镇政府、街道办事处提交证据并详细反映情况。
- 这些部门将依据相关法规对侵占行为进行调查，并可能责令侵占者停止违法行为，退还被侵占的土地，甚至作出行政处罚。
寻求村民委员会协助：
- 向村民委员会反映情况，请求其进行调解或采取其他必要措施。
- 村民委员会作为基层群众性自治组织，在处理此类纠纷中具有一定的权威性和调解能力。
提起民事诉讼：
- 若行政途径未能有效解决问题，或村民认为有必要通过司法途径维权，可以集体名义向人民法院提起民事诉讼。
- 在诉讼中，需提供充分证据证明侵占行为及其对集体造成的损害，要求侵占者返还土地、恢复原状，并赔偿损失。
考虑刑事自诉（视情节严重程度）：
- 若侵占行为情节严重，如非法占用耕地数量较大、造成耕地大量毁坏等，可能涉嫌构成非法占用农用地罪等刑事犯罪。
- 在这种情况下，除相关部门可刑事立案侦查外，村民也可考虑依法提起刑事自诉。
三、注意事项
- 在控告过程中，村民应保持冷静、理性，遵循法律程序，确保每一步都合法合规。
- 注重证据的收集和保存，为后续的维权行动提供有力支持。
- 若对法律程序不熟悉或感到困惑，可以寻求专业律师的帮助，以确保控告的顺利进行。
综上所述，村民对村集体土地耕地被侵占的行为完全有权进行控告，并可以通过多种途径来维护集体的合法权益。在处理过程中，务必遵循法律程序，确保每一步都合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。