执业人在医院上班存在违法所得的，其执行方式主要依据违法所得的性质、来源以及相关法律法规的规定，一般通过没收违法所得、罚款、追缴等措施执行，具体如下：

1. 没收违法所得：

   • 如果执业人在医院上班期间通过非法手段（如收受回扣、贿赂、欺诈等）获取了违法所得，根据《中华人民共和国刑法》及相关法律法规的规定，这些违法所得应当被依法没收。
   • 没收违法所得通常由司法机关（如法院）在判决中明确，并由相关执行机关（如公安机关、法院执行庭等）负责具体执行。

2. 罚款：

   • 除了没收违法所得外，执业人还可能因违法行为受到罚款的处罚。罚款的数额根据违法行为的性质、情节以及造成的后果等因素确定。
   • 罚款的执行同样由司法机关或相关行政机关负责，确保罚款及时、足额地缴纳。

3. 追缴与退赔：

   • 如果执业人的违法所得已经部分或全部转移给第三方，或者已经用于消费、投资等，司法机关可能会根据实际情况采取追缴措施，尽力挽回损失。
   • 同时，如果违法行为给医院或患者造成了经济损失，执业人还可能需要承担退赔责任，即赔偿因违法行为给受害方造成的损失。

4. 执行程序：

   • 在执行过程中，司法机关会依法进行调查取证，确定违法所得的具体数额和来源。
   • 然后，根据判决或裁定结果，采取相应的执行措施，如查封、扣押、冻结财产等，以确保违法所得得到有效执行。

5. 特殊情况处理：

   • 如果执业人拒不执行判决或裁定，司法机关可以采取强制执行措施，如强制划拨银行账户资金、拍卖财产等。
   • 对于情节严重、构成犯罪的，还可能依法追究刑事责任。