合同效力需结合具体情况判断，仅有一份承包方持有的合同，并不直接导致合同无效，但可能影响合同履行的证据效力及双方权利义务的明确性。以下从不同角度进行分析：

1. 合同生效的基本条件
   根据《民法典》第143条，合同生效需满足：

   • 行为人具有相应民事行为能力；
     
   • 意思表示真实；
     
   • 不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
     若合同内容符合上述条件，即使仅有一份由承包方持有，合同本身仍可能依法成立并生效。但需注意，土地承包合同需符合《农村土地承包法》的特别规定（如发包方资格、承包程序等），否则可能因违法而无效。

2. 合同形式与份数的影响

   • 书面形式要求：根据《农村土地承包法》第22条，土地承包合同应当采用书面形式。若合同已书面订立，即使仅有一份，仍满足形式要件。
     
   • 份数与证据效力：合同份数不影响其法律效力，但多份合同（如双方各执一份）可避免单方篡改风险，增强证据效力。若仅有一份合同且由承包方持有，发包方可能否认合同内容，此时承包方需通过其他证据（如履行行为、证人证言等）证明合同存在及内容。

3. 实务风险与建议

   • 风险点：
     
     • 发包方可能以“未签订合同”或“合同未生效”为由拒绝履行义务；
       
     • 合同条款（如承包期限、费用、权利义务）可能因单方持有而被质疑真实性或公平性。
       
   • 建议措施：
     
     • 尽快与发包方补签合同，确保双方各执一份；
       
     • 保留合同履行证据（如缴费凭证、土地使用记录等）；
       
     • 若发生纠纷，可申请司法鉴定或通过调解、诉讼程序确认合同效力。

总结：合同效力需以内容合法性为核心判断标准，份数仅影响证据效力。为降低风险，建议完善合同形式并固定履行证据。如有具体争议，可进一步提供合同条款及履行细节，以便针对性分析。