您好，关于宝宝超过时间办理出生证是否需要爸爸妈妈都做亲子鉴定的问题，这确实是一个涉及具体流程和地区差异的问题，我来为您详细解答。
首先，结论前置：超过一年申请开具出生证明，通常确实需要进行亲子鉴定以确认生物学父母身份。但具体是与父亲还是母亲，或双方同时做鉴定，这需要根据当地的具体要求和实际情况来确定。
接下来，我为您详细分析：
亲子鉴定的必要性： 当超过规定时间申请开具出生证明时，进行亲子鉴定是为了确保出生证明的准确性和合法性。这是保护孩子及其家庭合法权益的重要步骤，因为出生证明是孩子身份和血缘关系的重要法律文件。
与父亲或母亲的亲子鉴定： 在中国，相关法规并未明确规定必须选择做父亲或母亲的亲子鉴定。但在实际操作中，由于父亲的基因更容易被检测出来，且父亲身份的确认对于孩子的身份认定具有重要意义，因此通常会优先考虑做父亲的亲子鉴定。然而，如果母亲的身份也存在疑问，或者当地有特定要求，那么可能需要进行母亲的亲子鉴定，甚至有些地方会要求与父母双方同时进行亲子鉴定，以更全面、准确地确定亲子关系。
地区差异与具体要求： 不同地区和医院对于亲子鉴定的具体要求可能存在差异。有些地区在补办出生证明时，如果有一方能够提供确切的证明材料（如分娩记录、住院病历等），可能只需孩子与另一方做亲子鉴定即可。因此，在办理前，我强烈建议您提前联系孩子出生的医院或当地卫生健康部门、妇幼保健院（所）或户口登记机关，了解详细的补办流程和所需材料，并按照他们的指引进行操作。
法律依据： 根据《中华人民共和国出生医学证明管理办法》的相关规定，出生医学证明的申请、审核、签发等程序应当符合法律、法规和规章的规定。如果需要进行亲子鉴定，也应当依照有关法律、法规的规定进行。这确保了整个过程的合法性和规范性。
综上所述，超过一年申请开具出生证明时，亲子鉴定是必要的步骤。但具体是与父亲、母亲还是双方同时做鉴定，需根据当地的具体要求和实际情况来确定。在整个过程中，请务必遵循相关法律法规和规定，确保出生证明的准确性和合法性。如果您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告诉我。