妻子指使儿子打父亲的行为可能涉及多个法律层面的处理，具体需根据行为性质、伤害后果及各主体年龄等因素综合判断，以下分情况说明：

1. 若儿子已达刑事责任年龄（一般16周岁以上，特定情形14周岁以上）

• 妻子可能构成“教唆犯罪”：根据《刑法》第二十九条，教唆他人犯罪的，按照所教唆的罪定罪处罚。若儿子实施故意伤害行为构成犯罪（如故意伤害罪），妻子作为教唆者需承担同等刑事责任。例如，儿子将父亲打成轻伤以上，妻子可能被以故意伤害罪共犯论处。
• 儿子独立承担刑事责任：若儿子具备完全刑事责任能力，其需自行承担故意伤害的刑事责任，妻子作为教唆者从重处罚（如从犯或主犯，视教唆程度而定）。

2. 若儿子未达刑事责任年龄（一般14周岁以下）

• 妻子可能单独构成犯罪：儿子因年龄不承担刑事责任，但妻子作为教唆者可能直接构成故意伤害罪的间接正犯（即利用无责任能力人实施犯罪）。例如，妻子指使年幼儿子殴打父亲致轻伤以上，妻子需单独承担刑事责任。
• 行政处罚可能性：若伤害后果未达刑事标准（如轻微伤），妻子可能因违反《治安管理处罚法》第四十三条（殴打他人）被处以行政拘留或罚款。

3. 家庭暴力与民事赔偿

• 家庭暴力认定：根据《反家庭暴力法》，妻子指使儿子殴打父亲属于家庭成员间的暴力行为，父亲可向公安机关报案或向法院申请人身安全保护令。
• 民事赔偿请求：父亲有权依据《民法典》第一千一百七十九条要求妻子及儿子（若成年）赔偿医疗费、护理费等经济损失；若儿子未成年，妻子作为监护人需承担赔偿责任。

4. 特殊情形：儿子年龄与行为能力

• 若儿子为限制民事行为能力人（8-18周岁）：其需承担与其年龄、智力相适应的责任，妻子作为监护人可能需补充赔偿；若儿子完全无民事行为能力（如不满8周岁），妻子需承担全部赔偿责任。

关键建议：

1. 立即取证：保留医疗记录、报警回执、证人证言等证据，以证明伤害事实及教唆关系。
2. 区分责任主体：根据儿子年龄及行为后果，明确妻子是单独担责还是与儿子共担责任。
3. 综合救济途径：同步启动刑事报案、行政投诉及民事赔偿程序，最大化维护父亲权益。

具体处理需结合案件细节，如需进一步分析，可直接向我提供更多信息（如伤害程度、儿子年龄等）。