结论：肇事者不是车主的情况下，在满足一定条件时，仍然可以保全车辆。以下是对此问题的详细解析：
一、保全的法律依据
根据《民事诉讼法》的相关规定，利害关系人因情况紧急，不立即申请保全将会使其合法权益受到难以弥补的损害的，可以在提起诉讼或者申请仲裁前向相关人民法院申请采取保全措施。这一规定为肇事车辆的保全提供了明确的法律基础，无论肇事者是否为车主，只要车辆与案件有关联且保全措施对于保障受害人权益或案件处理有必要，均可依法进行保全。
二、保全的条件
车辆实际由肇事司机控制、使用：
- 如果肇事车辆在事故发生时由肇事司机实际控制和使用，且存在转移、隐匿等逃避赔偿责任的风险，那么可以申请对该车辆进行保全。例如，肇事司机借用他人车辆发生事故后，为防止其藏匿车辆导致受害人难以获得赔偿，受害人有权申请保全。
车辆与肇事行为存在关联：
- 当车辆本身的安全隐患或其他问题对事故发生起到一定作用时，即便车主并非肇事司机，也可考虑对车辆进行保全。这种情况下，保全车辆有助于后续的责任认定和赔偿实现。
车主过错考量：
- 在申请保全时，还需考虑车主是否存在过错。如果车主将车辆借给无驾驶资格的人或车辆存在安全隐患而未及时维修等，导致事故发生，那么保全车辆的可能性更大。
三、保全的法律程序
提交申请：
- 利害关系人（如交通事故中的受害人）需向法院提交财产保全申请书及相关证据，包括事故现场照片、证人证言、车辆使用记录等，以证明车辆与肇事行为的关联性以及保全的必要性。
法院审查：
- 法院在受理申请后，会对情况进行审查，判断是否符合保全条件。若认为符合保全条件，将作出保全裁定。
执行保全：
- 法院作出保全裁定后，将通知相关部门执行查封、扣押等保全措施，禁止车辆进行过户、转让等处分行为。
解除或变更保全：
- 若车辆所有人能证明自己对事故发生没有过错，且车辆被保全可能对其造成重大损失，可以向法院提出异议。法院会根据具体情况进行审查判断，决定是否解除或变更保全措施。同时，肇事方也可以通过提供担保等方式申请解除保全。
四、注意事项
及时申请：
- 利害关系人应在知道或应当知道其权益受到损害后，及时向法院申请保全，以避免错过最佳时机。
提供担保：
- 申请保全时，申请人应提供相应的担保，以确保在保全错误或给被申请人造成损失时能够承担赔偿责任。
遵循法定程序：
- 保全必须严格遵循法定程序和条件进行，否则可能导致保全无效或承担法律责任。
五、实际案例与建议
实际案例：假设某起交通事故中，肇事司机借用朋友的车辆发生事故，导致受害人受伤。受害人担心肇事司机会藏匿车辆以逃避赔偿责任，于是向法院申请保全该车辆。法院在审查后认为符合保全条件，遂作出保全裁定，对车辆进行了查封。
建议：在类似情况下，受害人应尽快收集相关证据，如事故现场照片、证人证言等，以证明车辆与肇事行为的关联性以及保全的必要性。同时，及时向法院提交财产保全申请书，并按照法院要求提供担保。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。