在基本农田上打瓦斯孔抽排瓦斯属于违法行为，一般不存在合法赔付情形；若因该违法行为造成损失，侵权方需承担民事赔偿责任，具体赔付需根据实际损失情况确定。以下从不同角度为你详细分析：

违法性角度

基本农田是依据土地利用总体规划确定的不得占用的耕地，受到国家法律的严格保护。根据《中华人民共和国土地管理法》第三十七条规定，禁止占用永久基本农田发展林果业和挖塘养鱼，打瓦斯孔抽排瓦斯这种行为显然改变了基本农田的用途，破坏了基本农田的耕作层和生态环境，属于违法行为。对于这种违法行为，首先面临的是行政处罚，如责令限期改正、罚款等，而不是合法意义上的赔付问题。

民事赔偿角度

如果因为打瓦斯孔抽排瓦斯的行为，给基本农田的所有者或者使用者造成了实际的损失，比如农作物减产、土地质量下降等，那么侵权方需要承担民事赔偿责任。具体的赔付金额和方式需要根据实际损失情况来确定，一般包括以下几个方面：

1. 直接损失：例如因土地破坏导致农作物无法正常生长而造成的产量减少，按照市场价格计算这部分损失的价值；还有为了恢复土地原状而产生的合理费用，如购买肥料、进行土壤改良等费用。
2. 间接损失：如果因为土地受损导致农民在一定时间内无法正常耕种，从而影响了其收入，这部分预期收入的减少也可以作为间接损失要求赔偿。不过，间接损失的认定和计算相对复杂，需要综合考虑多种因素，如当地的农业生产水平、农民的平均收入等。

赔偿程序角度

1. 协商解决：受损方可以与侵权方进行协商，就赔偿金额、赔偿方式等达成一致意见，并签订赔偿协议。这种方式比较灵活、高效，能够节省时间和成本。
2. 调解处理：如果双方协商不成，可以申请当地的农村土地承包仲裁委员会或者人民调解委员会等机构进行调解。调解机构会根据双方的陈述和证据，提出调解方案，促使双方达成和解。
3. 诉讼途径：如果调解也无法解决问题，受损方可以向人民法院提起民事诉讼，要求侵权方承担赔偿责任。在诉讼过程中，法院会根据双方提供的证据和相关法律规定，作出公正的判决。

如果你遇到了在基本农田上打瓦斯孔抽排瓦斯导致损失的情况，可以向我详细描述具体细节，比如损失的程度、侵权方的情况等，我会为你进一步分析并提供更具体的建议。