公司被立案后，仍然可以申请变更登记，但需根据具体情况判断是否会受到限制或影响。以下从不同角度为您详细分析：
一、公司变更登记的基本规定
根据《中华人民共和国公司法》及相关登记管理条例，公司变更登记是公司运营过程中的常规事项，包括但不限于公司名称、住所、法定代表人、注册资本、经营范围等事项的变更。只要公司符合变更登记的条件，并按照规定提交相关材料，就可以向登记机关申请变更登记。
二、公司被立案对变更登记的影响
一般情况下的影响：
- 公司被立案，通常指的是公司因涉嫌违法违规行为被相关机关（如公安机关、检察机关、市场监管部门等）立案调查。这并不意味着公司自动丧失变更登记的权利。
- 在立案调查期间，如果公司需要变更登记事项，且该变更不涉及立案调查的内容或不影响调查的进行，那么公司仍然可以正常申请变更登记。
特殊情况下的限制：
- 如果立案调查的内容与公司的变更登记事项直接相关，或者变更登记可能影响调查的进行或结果的，相关机关可能会对公司变更登记申请进行限制或暂缓处理。
- 例如，如果公司因涉嫌虚假出资被立案调查，而此时公司申请变更注册资本，那么登记机关可能会要求公司先解决立案调查的问题，或者提供充分的证据证明变更注册资本的合法性和合理性。
三、实际操作中的建议
了解立案调查的具体情况：
- 在申请变更登记前，公司应首先了解立案调查的具体情况，包括调查的原因、内容、进展等，以便判断变更登记是否可能受到影响。
咨询登记机关的意见：
- 如果公司不确定变更登记是否会受到立案调查的影响，可以提前咨询登记机关的意见。登记机关会根据公司的具体情况和立案调查的情况，给出相应的指导和建议。
准备充分的材料：
- 在申请变更登记时，公司应准备充分的材料，证明变更登记的合法性和合理性。如果变更登记涉及立案调查的内容，公司还应提供相关证据或说明，以消除登记机关的疑虑。
四、可能的法律后果
- 如果公司在立案调查期间擅自进行变更登记，且该变更涉及立案调查的内容或影响调查的进行，那么公司可能面临行政处罚或法律责任。
- 因此，公司在申请变更登记前，应务必谨慎评估变更登记的必要性和合法性，避免因不当变更而引发不必要的法律风险。
总结来说，公司被立案后仍然可以申请变更登记，但需根据具体情况判断是否会受到限制或影响。如果您有具体的变更登记需求或疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。