结论前置：请年假通常不会扣全勤奖，因为年假是法律赋予劳动者的合法权益，且享受与正常工作期间相同的工资收入。然而，具体是否会影响全勤奖，还需参考公司的具体规定及劳动合同中的相关条款。

一、法律依据与年休假性质

根据《职工带薪年休假条例》的规定，连续工作1年以上的职工有权享受带薪年休假，且在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。这表明年休假是劳动者的法定权利，休假期间应视为正常出勤，用人单位不得因此扣减员工的工资或福利待遇，包括全勤奖。

二、全勤奖的评定与年休假的关系

1. 公司规章制度明确规定的情况：

   • 若公司规章制度中明确指出，年休假不影响全勤奖的评定，即年休假、调休等法定可休假期不视为缺勤，那么员工在依法休年假且满足其他全勤条件时，应获得全勤奖。
   • 反之，如果公司规章制度将年休假纳入缺勤计算范围，并规定请假（包括年假）就不能获得全勤奖，那么在这种情况下，员工请年假后将无法获得全勤奖。但需注意，这样的规定不能违反法律法规关于年休假的基本权益保障，否则该规定可能无效。

2. 公司没有明确规定的情况：

   • 在没有明确规章制度限制的情况下，从法律公平合理的角度出发，年休假是员工依法享有的休息权利，与因个人过错导致的缺勤有本质区别。因此，员工休年假不应影响全勤奖的获取。

三、实践中的操作与建议

1. 查看公司规定：

   • 员工在入职时应仔细审查劳动合同中关于全勤奖金和年休假的相关规定。对于不明确的地方，应向公司的人力资源部门或相关负责人咨询清楚，以避免产生纠纷。

2. 沟通协商：

   • 如果公司规定中存在不明确或不合理之处，员工应与人力资源部门进行沟通协商，寻求合理的解决方案。例如，可以提出将年休假视为正常出勤，不影响全勤奖的评定。

3. 维护权益：

   • 若公司拒绝遵守法律规定或合理规定，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。在投诉或申请仲裁时，员工应提供相关证据，如劳动合同、公司规章制度、年休假申请记录等，以证明自己的权益受到侵害。

四、特殊情况处理

• 如果公司因经营需要或其他特殊原因，需要调整年休假安排或全勤奖评定标准，应提前与员工进行协商，并达成一致意见。未经员工同意，公司不得单方面改变相关规定或标准。

总结：请年假通常不会扣全勤奖，但具体是否会影响全勤奖还需参考公司的具体规定。员工应了解自己的权益和公司规定，以便在必要时采取适当的行动来维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。